46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0153 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0153  hypothetical protein  100 
 
 
501 aa  1031    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  41.3 
 
 
216 aa  178  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0069  protein of unknown function DUF1080  38.12 
 
 
209 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1177  protein of unknown function DUF1080  38.26 
 
 
214 aa  160  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  30.66 
 
 
212 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  29.26 
 
 
1505 aa  73.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  29.49 
 
 
231 aa  71.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  31.22 
 
 
451 aa  70.5  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  31.36 
 
 
222 aa  69.7  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  29.18 
 
 
1444 aa  69.3  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  27.27 
 
 
226 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  28.74 
 
 
261 aa  65.1  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5403  protein of unknown function DUF1080  27.19 
 
 
240 aa  64.7  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  27.95 
 
 
240 aa  63.9  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  27.68 
 
 
237 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0347  hypothetical protein  29.13 
 
 
215 aa  59.7  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0627  protein of unknown function DUF1080  24.66 
 
 
558 aa  58.9  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  25.49 
 
 
260 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  24.27 
 
 
453 aa  58.2  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  28.11 
 
 
451 aa  57.8  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0966  protein of unknown function DUF1080  22.75 
 
 
259 aa  57.4  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0225828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  25.57 
 
 
198 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  26.46 
 
 
234 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  26.36 
 
 
230 aa  54.7  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  26.29 
 
 
198 aa  54.7  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3175  protein of unknown function DUF1080  22.87 
 
 
258 aa  54.3  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  25.79 
 
 
453 aa  54.3  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  25.51 
 
 
247 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3047  protein of unknown function DUF1080  26.32 
 
 
242 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  27.2 
 
 
239 aa  51.6  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0295  protein of unknown function DUF1080  24.35 
 
 
212 aa  51.6  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154289  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  23.87 
 
 
1145 aa  51.2  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  25.55 
 
 
1194 aa  50.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  27.05 
 
 
238 aa  51.2  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  25.45 
 
 
1140 aa  50.8  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  29.86 
 
 
241 aa  48.5  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  26.38 
 
 
211 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  27.9 
 
 
452 aa  48.5  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0884  hypothetical protein  23.69 
 
 
259 aa  47  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  23.21 
 
 
239 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  26.79 
 
 
217 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  21.33 
 
 
515 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  26.17 
 
 
255 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3167  protein of unknown function DUF1080  27.4 
 
 
1046 aa  45.1  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213021  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  31.25 
 
 
455 aa  43.9  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1177  phosphotransferase domain-containing protein  28.57 
 
 
243 aa  43.5  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.133886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>