42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0884 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0884  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  541  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6435  protein of unknown function DUF1080  43.19 
 
 		 280 aa  217  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3718  protein of unknown function DUF1080  43.55 
 
 		 311 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3672  protein of unknown function DUF1080  43.75 
 
 		 276 aa  211  9e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6281  protein of unknown function DUF1080  39.22 
 
 		 281 aa  209  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4607  hypothetical protein  45.87 
 
 		 276 aa  206  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4250  protein of unknown function DUF1080  38.82 
 
 		 287 aa  204  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2898  protein of unknown function DUF1080  42.34 
 
 		 299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.631607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1630  hypothetical protein  42.11 
 
 		 276 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  32.55 
 
 		 230 aa  90.1  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3043  hypothetical protein  26.87 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.602571  hitchhiker  0.000740965 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0094  hypothetical protein  24.49 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  26.36 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4135  protein of unknown function DUF1080  28.39 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.848407  normal  0.434516 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  27.8 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3573  hypothetical protein  26.17 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5719  protein of unknown function DUF1080  26.55 
 
 		 298 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753929 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1851  hypothetical protein  25.67 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  24.32 
 
 		 222 aa  65.1  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  26.34 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1162  protein of unknown function DUF1080  29.89 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  26.07 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  25.55 
 
 		 241 aa  53.5  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  24.89 
 
 		 198 aa  52  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3533  hypothetical protein  22.61 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  23.37 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  22.85 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1206  protein of unknown function DUF1080  24.72 
 
 		 229 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  25.1 
 
 		 1140 aa  49.7  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  23.85 
 
 		 452 aa  49.3  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0775  hypothetical protein  25.45 
 
 		 329 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.815989  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  25.95 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  23.87 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0153  hypothetical protein  23.69 
 
 		 501 aa  47  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  22.18 
 
 		 240 aa  46.2  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  22.13 
 
 		 451 aa  46.2  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  25.62 
 
 		 234 aa  46.2  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3047  protein of unknown function DUF1080  22.71 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2283  protein of unknown function DUF1080  24.62 
 
 		 313 aa  44.7  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835923  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  22.39 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1177  protein of unknown function DUF1080  25.38 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  25 
 
 		 440 aa  42.4  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>