14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2898 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2898  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 		 299 aa  627  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.631607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3718  protein of unknown function DUF1080  65 
 
 		 311 aa  391  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4250  protein of unknown function DUF1080  53.06 
 
 		 287 aa  316  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6435  protein of unknown function DUF1080  50.18 
 
 		 280 aa  290  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6281  protein of unknown function DUF1080  52.57 
 
 		 281 aa  278  5e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3672  protein of unknown function DUF1080  48.68 
 
 		 276 aa  251  1e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0884  hypothetical protein  40.66 
 
 		 259 aa  204  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1630  hypothetical protein  41.67 
 
 		 276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4607  hypothetical protein  41.37 
 
 		 276 aa  189  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3573  hypothetical protein  23.27 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1851  hypothetical protein  23.08 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  26.51 
 
 		 452 aa  48.9  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1206  protein of unknown function DUF1080  29.01 
 
 		 229 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4135  protein of unknown function DUF1080  21.65 
 
 		 291 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.848407  normal  0.434516 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>