54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7244 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 		 198 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  61.11 
 
 		 198 aa  259  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  67.24 
 
 		 211 aa  255  4e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0347  hypothetical protein  35.18 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  36.67 
 
 		 451 aa  117  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  34.76 
 
 		 453 aa  105  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  33.49 
 
 		 515 aa  100  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  33.33 
 
 		 455 aa  92.8  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  32.63 
 
 		 440 aa  89.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  32.7 
 
 		 452 aa  87.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  35.94 
 
 		 217 aa  84.3  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  31.34 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0295  protein of unknown function DUF1080  34.04 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  30.9 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  31.58 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6337  protein of unknown function DUF1080  31.82 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.975208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  29.49 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4053  protein of unknown function DUF1080  26.78 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0552867  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  32.14 
 
 		 326 aa  67  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3175  protein of unknown function DUF1080  28.11 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  29.65 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1177  protein of unknown function DUF1080  30.81 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  29.29 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  31.68 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  30.32 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  28.39 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  31.25 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  28 
 
 		 453 aa  62.8  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  31.17 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0966  protein of unknown function DUF1080  26.4 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0225828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  29.81 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  30.14 
 
 		 260 aa  61.6  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0069  protein of unknown function DUF1080  28.12 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  30.92 
 
 		 308 aa  57.8  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  27.96 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1206  protein of unknown function DUF1080  27 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0627  protein of unknown function DUF1080  27.18 
 
 		 558 aa  55.5  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  26.49 
 
 		 1145 aa  54.7  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0884  hypothetical protein  24.9 
 
 		 259 aa  54.3  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0153  hypothetical protein  26.7 
 
 		 501 aa  54.3  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  27.34 
 
 		 322 aa  53.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  27.21 
 
 		 241 aa  52  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3047  protein of unknown function DUF1080  30.32 
 
 		 242 aa  51.6  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  27.74 
 
 		 238 aa  51.6  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  27.27 
 
 		 1140 aa  51.6  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  26.64 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  26.56 
 
 		 451 aa  50.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3167  protein of unknown function DUF1080  24.86 
 
 		 1046 aa  49.7  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213021  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  25.87 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0248  protein of unknown function DUF1080  21.79 
 
 		 290 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5719  protein of unknown function DUF1080  23.81 
 
 		 298 aa  45.1  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  27.22 
 
 		 231 aa  42.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  25 
 
 		 1444 aa  42  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  26.06 
 
 		 321 aa  41.2  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>