39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0347 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0347  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  436  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  52.91 
 
 
451 aa  192  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  35.64 
 
 
198 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  31.07 
 
 
198 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  34.86 
 
 
211 aa  100  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  31.9 
 
 
217 aa  90.5  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  32.64 
 
 
452 aa  79.7  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0295  protein of unknown function DUF1080  28.29 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154289  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  30.1 
 
 
515 aa  76.6  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6337  protein of unknown function DUF1080  29.84 
 
 
218 aa  71.6  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.975208  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2202  protein of unknown function DUF1080  30.3 
 
 
453 aa  70.5  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  30.05 
 
 
230 aa  68.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  31.55 
 
 
455 aa  63.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7254  protein of unknown function DUF1080  30.95 
 
 
440 aa  60.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000293635  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  30.11 
 
 
197 aa  60.5  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  27.4 
 
 
231 aa  60.1  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0153  hypothetical protein  29.35 
 
 
501 aa  59.3  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  30.34 
 
 
193 aa  59.3  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  24.67 
 
 
226 aa  58.9  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  27.08 
 
 
212 aa  57.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0627  protein of unknown function DUF1080  26.41 
 
 
558 aa  57.8  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4053  protein of unknown function DUF1080  28.38 
 
 
244 aa  55.5  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0552867  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  28.74 
 
 
451 aa  54.3  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  29.17 
 
 
234 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  29.19 
 
 
261 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  33.82 
 
 
326 aa  49.7  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  26.6 
 
 
237 aa  49.3  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  28.39 
 
 
322 aa  48.5  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  24.05 
 
 
239 aa  47.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2243  protein of unknown function DUF1080  24.1 
 
 
884 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  28.37 
 
 
1145 aa  46.6  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  25.58 
 
 
216 aa  45.8  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  26.69 
 
 
247 aa  45.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  27.27 
 
 
1444 aa  45.1  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  29.73 
 
 
1140 aa  44.3  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  25.81 
 
 
1505 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  25.76 
 
 
260 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  27.86 
 
 
321 aa  43.9  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3175  protein of unknown function DUF1080  23.98 
 
 
258 aa  42  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>