152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1166 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1166  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
447 aa  914    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  57.84 
 
 
424 aa  481  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2125  GDSL family lipase  35.03 
 
 
261 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.849583  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  30.91 
 
 
255 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  39.23 
 
 
261 aa  96.3  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3728  lipolytic protein G-D-S-L family  31.16 
 
 
257 aa  92  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0881256  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2497  exo-1,4-beta-glucosidase  33.5 
 
 
1072 aa  90.1  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2912  1-alkyl-2-acetylglycerophosphocholine esterase  33.68 
 
 
268 aa  88.2  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3780  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.16 
 
 
221 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0125  lipolytic protein G-D-S-L family  28.35 
 
 
249 aa  82.8  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.299252  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3112  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.67 
 
 
287 aa  80.1  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2193  lipolytic protein G-D-S-L family  31.79 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.689608  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2957  lipolytic protein  30.81 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903412  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1104  platelet activating factor, putative  27.23 
 
 
204 aa  72.4  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3012  lipolytic protein  30.86 
 
 
383 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  23.47 
 
 
227 aa  71.2  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0965245  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2269  GDSL family lipase  30.2 
 
 
235 aa  71.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0100927 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2123  GDSL family lipase  28.29 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1258  G-D-S-L family lipolytic protein  28.57 
 
 
274 aa  70.5  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44063  predicted protein  29.69 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.213778  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4478  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.23 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0578  lipolytic protein G-D-S-L family  30.29 
 
 
228 aa  68.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.695462  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01237  acetylhydrolase  30.99 
 
 
479 aa  68.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.507757  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1746  GDSL family lipase  27.46 
 
 
238 aa  68.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.761874 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2175  lipolytic protein G-D-S-L family  27.27 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.045511 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0670  GDSL family lipase  28.09 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3977  lipolytic protein G-D-S-L family  27.32 
 
 
593 aa  67.4  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410599  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2205  G-D-S-L family lipolytic protein  29.88 
 
 
372 aa  66.2  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0392417  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0022  lipolytic protein G-D-S-L family  27.92 
 
 
236 aa  65.9  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.954295 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2134  GDSL family lipase  31.74 
 
 
248 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.306238  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2921  cyclic nucleotide-binding protein  27.98 
 
 
871 aa  64.3  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5066  lipolytic protein G-D-S-L family  26.16 
 
 
217 aa  63.5  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0170642  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0686  acyl-CoA thioesterase I precursor  27.33 
 
 
206 aa  63.2  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1716  lipolytic protein  29.79 
 
 
194 aa  62.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000204836  normal  0.492944 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1951  GDSL family lipase  26.51 
 
 
268 aa  63.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720297 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1526  GDSL family lipase  26.09 
 
 
206 aa  61.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0224358  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0344  lipolytic protein G-D-S-L family  28.88 
 
 
243 aa  61.2  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00761179  normal  0.124029 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3371  GDSL family lipase  29.03 
 
 
648 aa  60.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754827  normal  0.777259 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0772  GDSL family lipase  23.91 
 
 
201 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1022  lipolytic protein G-D-S-L family  24.88 
 
 
321 aa  60.1  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2575  lipolytic protein G-D-S-L family  27.27 
 
 
280 aa  58.9  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0191  GDSL family lipase  29.41 
 
 
201 aa  58.5  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40919  predicted protein  25.57 
 
 
422 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  24.68 
 
 
451 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2682  lipolytic protein G-D-S-L family  24 
 
 
593 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1162  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.82 
 
 
183 aa  57.4  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0219  hypothetical protein  26.67 
 
 
197 aa  57  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0736207  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1357  lipolytic protein G-D-S-L family  25.58 
 
 
257 aa  56.6  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0467272  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0355  hypothetical protein  24.7 
 
 
248 aa  56.2  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2847  GDSL family lipase  29.89 
 
 
230 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0175808  normal  0.606951 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4982  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.92 
 
 
186 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4395  lipolytic protein G-D-S-L family  26.97 
 
 
213 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.750338  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  26.98 
 
 
223 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2141  GDSL family lipase  29.73 
 
 
192 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.336589  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4475  lipolytic protein G-D-S-L family  28.88 
 
 
218 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  26.67 
 
 
223 aa  54.3  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0043  GDSL family lipase  27.42 
 
 
202 aa  54.3  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000938694  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2141  GDSL family lipase  27.57 
 
 
189 aa  53.9  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.953926  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1544  lipolytic protein G-D-S-L family  23.6 
 
 
260 aa  53.9  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158238  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2115  lipolytic protein G-D-S-L family  26.92 
 
 
329 aa  53.9  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1045  hypothetical protein  27.89 
 
 
152 aa  53.5  0.000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.517401  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0446  lipolytic protein G-D-S-L family  27.23 
 
 
243 aa  53.1  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1812  lipolytic protein G-D-S-L family  24.64 
 
 
264 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000302668  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3205  GDSL family lipase  28.49 
 
 
201 aa  53.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765552  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3994  GDSL family lipase  28.42 
 
 
216 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2484  lipolytic protein G-D-S-L family  24.26 
 
 
265 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2747  lysophospholipase L1-like protein  27.78 
 
 
195 aa  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2269  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.12 
 
 
225 aa  52.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00077116  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0817  lipolytic protein G-D-S-L family  26.76 
 
 
331 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00788434 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  29.84 
 
 
204 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  24.75 
 
 
326 aa  51.2  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0711  lipolytic protein G-D-S-L family  28.21 
 
 
241 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2959  arylesterase  28.91 
 
 
202 aa  51.6  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  26.52 
 
 
255 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0831  GDSL family lipase  28.04 
 
 
248 aa  51.6  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.386587  normal  0.0593626 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0654  lipolytic protein G-D-S-L family  27.84 
 
 
233 aa  51.6  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428767  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  31.88 
 
 
251 aa  51.2  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4363  lipolytic protein G-D-S-L family  27.07 
 
 
216 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2677  lipolytic protein  29.51 
 
 
233 aa  50.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0490394  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0430  acyl-CoA thioesterase I  27.66 
 
 
189 aa  50.4  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000157795  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0074  GDSL family lipase  30.16 
 
 
234 aa  50.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3734  GDSL family lipase  26.26 
 
 
207 aa  49.3  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00414819  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1068  Arylesterase  26.95 
 
 
255 aa  49.7  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  29.14 
 
 
1145 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5471  GDSL family lipase  25.95 
 
 
257 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1546  lipolytic protein G-D-S-L family  24.53 
 
 
262 aa  48.9  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.563827  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3427  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  25.41 
 
 
188 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4910  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25 
 
 
329 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  28.96 
 
 
210 aa  48.5  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0220  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.36 
 
 
327 aa  47.8  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0520  GDSL family lipase  27.32 
 
 
212 aa  47.8  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  24.4 
 
 
1234 aa  47.8  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4335  hypothetical protein  25.28 
 
 
230 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.400802 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3116  Lysophospholipase  26.87 
 
 
197 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0574  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  26.87 
 
 
207 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3122  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  26.87 
 
 
197 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102702 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0543  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  26.87 
 
 
207 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0429  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  26.87 
 
 
207 aa  47.4  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0598  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  26.87 
 
 
207 aa  47  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.79584 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00445  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  26.87 
 
 
208 aa  47  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>