15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0018 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0018  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 		 249 aa  515  1.0000000000000001e-145  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1607  protein of unknown function DUF1080  43.37 
 
 		 234 aa  149  6e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0308822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3499  protein of unknown function DUF1080  39.7 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0089925  normal  0.745497 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1169  hypothetical protein  29.79 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  26.98 
 
 		 239 aa  62  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2283  protein of unknown function DUF1080  26.13 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835923  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  27.32 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1206  protein of unknown function DUF1080  23.76 
 
 		 229 aa  53.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  27.05 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1162  protein of unknown function DUF1080  26.84 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  22.27 
 
 		 260 aa  48.9  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3358  hypothetical protein  26.84 
 
 		 272 aa  46.6  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0905705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  24.22 
 
 		 1145 aa  42.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  24.74 
 
 		 230 aa  42.7  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  34.92 
 
 		 1444 aa  42.4  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>