13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0811 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0811  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  635    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.170918  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4135  protein of unknown function DUF1080  36.93 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.848407  normal  0.434516 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5719  protein of unknown function DUF1080  34.47 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753929 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3533  hypothetical protein  36.4 
 
 		 290 aa  162  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0094  hypothetical protein  35.79 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3043  hypothetical protein  40.19 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.602571  hitchhiker  0.000740965 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0775  hypothetical protein  30.8 
 
 		 329 aa  133  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.815989  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1851  hypothetical protein  34.48 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3573  hypothetical protein  29.57 
 
 		 287 aa  95.5  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1169  hypothetical protein  22.53 
 
 		 224 aa  53.1  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1162  protein of unknown function DUF1080  24.6 
 
 		 253 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2283  protein of unknown function DUF1080  24.62 
 
 		 313 aa  46.2  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835923  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0884  hypothetical protein  25.64 
 
 		 259 aa  43.5  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>