20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2504 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2504  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  513  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1839  hypothetical protein  44.49 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.358856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3370  hypothetical protein  39.08 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.25108  normal  0.0308519 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3372  hypothetical protein  38.71 
 
 		 256 aa  159  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4280  hypothetical protein  28.4 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000396864  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2625  hypothetical protein  32.81 
 
 		 2311 aa  79.7  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.58 
 
 		 2668 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  29.12 
 
 		 2105 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1854  Pectate lyase  27.37 
 
 		 460 aa  52.4  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  26.95 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1855  Pectate disaccharide-lyase  27.37 
 
 		 653 aa  50.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2522  hypothetical protein  29.17 
 
 		 189 aa  50.1  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3987  hypothetical protein  26.87 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  22.93 
 
 		 801 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  23.03 
 
 		 197 aa  43.9  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  27.04 
 
 		 803 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1374  hypothetical protein  25 
 
 		 1362 aa  43.5  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1680  hypothetical protein  25 
 
 		 384 aa  43.5  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  25.16 
 
 		 801 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1739  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.23 
 
 		 824 aa  42.4  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0331952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>