42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4538 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4538  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  598  1e-170  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0275466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0591  hypothetical protein  48.38 
 
 		 327 aa  291  6e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1544  hypothetical protein  46.56 
 
 		 326 aa  276  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3566  hypothetical protein  28.37 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35008  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.63 
 
 		 1265 aa  59.3  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.45 
 
 		 1505 aa  59.7  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  29.38 
 
 		 392 aa  59.3  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1804  hypothetical protein  27.53 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 232 aa  52.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3989  hypothetical protein  26 
 
 		 214 aa  52.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  24.69 
 
 		 1194 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  29.84 
 
 		 1444 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  24.5 
 
 		 1135 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  27.27 
 
 		 285 aa  50.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  27.68 
 
 		 1138 aa  50.1  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4699  hypothetical protein  24.86 
 
 		 243 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.474373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  25.8 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.87 
 
 		 1274 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  24.75 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2953  hypothetical protein  24.8 
 
 		 213 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  24.88 
 
 		 1151 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0831  secreted glycosyl hydrolase  25.83 
 
 		 223 aa  47  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1628  hypothetical protein  25 
 
 		 308 aa  47  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107421  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  26.37 
 
 		 375 aa  47  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4188  hypothetical protein  30.66 
 
 		 214 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  29.41 
 
 		 1439 aa  46.6  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3860  hypothetical protein  30.66 
 
 		 214 aa  45.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0231605  normal  0.114316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.34 
 
 		 1180 aa  45.8  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 800 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.18 
 
 		 1200 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1863  hypothetical protein  24.4 
 
 		 213 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285265  normal  0.687336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1682  hypothetical protein  26.27 
 
 		 213 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  26.35 
 
 		 1182 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  26.4 
 
 		 219 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.48 
 
 		 1503 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  27.93 
 
 		 895 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1906  hypothetical protein  27.52 
 
 		 233 aa  43.9  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4526  sigma-70 factor  27.6 
 
 		 255 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1382  glycosyl hydrolase  22.83 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213541  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4406  hypothetical protein  25.74 
 
 		 217 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192664  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1220  sigma-70 factor  23.74 
 
 		 260 aa  43.5  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0178676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3453  hypothetical protein  31.19 
 
 		 217 aa  43.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318232 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>