39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1544 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1544  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  687    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0591  hypothetical protein  67.81 
 
 		 327 aa  480  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4538  hypothetical protein  46.8 
 
 		 290 aa  253  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0275466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3566  hypothetical protein  25.78 
 
 		 314 aa  100  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35008  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  27 
 
 		 1505 aa  66.6  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4699  hypothetical protein  26.42 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.474373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  28.16 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  29.35 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  28.16 
 
 		 1138 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4526  sigma-70 factor  31.07 
 
 		 255 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  28.26 
 
 		 1135 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  26.26 
 
 		 392 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.73 
 
 		 1180 aa  53.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2908  putative secreted glycosyl hydrolase  21.69 
 
 		 266 aa  53.1  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  27.5 
 
 		 1151 aa  53.1  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1906  hypothetical protein  24.72 
 
 		 233 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1803  hypothetical protein  26.21 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  23.03 
 
 		 1200 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0731  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 245 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 232 aa  50.4  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  24.73 
 
 		 1444 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1628  hypothetical protein  30.43 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107421  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1804  hypothetical protein  22.73 
 
 		 276 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.89 
 
 		 1503 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4608  hypothetical protein  20.83 
 
 		 258 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  26.88 
 
 		 1143 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3989  hypothetical protein  30.48 
 
 		 214 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.81 
 
 		 1265 aa  47  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  27.09 
 
 		 1142 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0811  hypothetical protein  20.3 
 
 		 245 aa  47  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.8275 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  26.09 
 
 		 275 aa  46.2  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4188  hypothetical protein  30.28 
 
 		 214 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3860  hypothetical protein  30.28 
 
 		 214 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0231605  normal  0.114316 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2953  hypothetical protein  25.71 
 
 		 213 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1220  sigma-70 factor  24.06 
 
 		 260 aa  43.9  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0178676  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  26.61 
 
 		 1439 aa  43.9  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1863  hypothetical protein  24.76 
 
 		 213 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285265  normal  0.687336 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  22.73 
 
 		 1182 aa  43.1  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1682  hypothetical protein  24.76 
 
 		 213 aa  42.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>