More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4398 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  100 
 
 		 1142 aa  2353    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  46.61 
 
 		 1135 aa  993    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  49.77 
 
 		 1143 aa  1060    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  62.05 
 
 		 1151 aa  1472    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0335  PKD domain containing protein  45.31 
 
 		 984 aa  833    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  44.68 
 
 		 1505 aa  677    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  45.03 
 
 		 1138 aa  992    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1903  Carbohydrate binding family 6  42.19 
 
 		 918 aa  662    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.602156  normal  0.263579 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  43.65 
 
 		 1182 aa  902    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4672  PKD domain containing protein  54.76 
 
 		 941 aa  971    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  43.33 
 
 		 909 aa  681    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1484  PKD domain containing protein  45.14 
 
 		 918 aa  827    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.287223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  43.29 
 
 		 1444 aa  625  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  41.42 
 
 		 1200 aa  613  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  39.34 
 
 		 908 aa  612  1e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 800 aa  590  1e-167  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.6 
 
 		 945 aa  398  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.6 
 
 		 953 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  32.15 
 
 		 1194 aa  376  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7276  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.7 
 
 		 272 aa  278  6e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0731  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.41 
 
 		 245 aa  264  8.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 232 aa  222  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  48.4 
 
 		 392 aa  210  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  42.86 
 
 		 247 aa  202  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1220  sigma-70 factor  40.41 
 
 		 260 aa  201  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0178676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  46.15 
 
 		 279 aa  199  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1804  hypothetical protein  43.89 
 
 		 276 aa  187  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  37.75 
 
 		 275 aa  178  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  42.4 
 
 		 895 aa  174  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4526  sigma-70 factor  40.77 
 
 		 255 aa  172  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  28.07 
 
 		 1029 aa  155  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0069  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 277 aa  149  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  34.6 
 
 		 285 aa  136  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  35.06 
 
 		 375 aa  129  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  23.4 
 
 		 1657 aa  119  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02570  glycosyl-hydrolase, putative  31.3 
 
 		 346 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1803  hypothetical protein  31.4 
 
 		 292 aa  108  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.37 
 
 		 442 aa  105  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  24.96 
 
 		 999 aa  105  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  24.96 
 
 		 999 aa  105  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  23.38 
 
 		 892 aa  104  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.18 
 
 		 396 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  31.67 
 
 		 387 aa  103  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  30.06 
 
 		 419 aa  103  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  28.18 
 
 		 413 aa  103  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  24.67 
 
 		 841 aa  103  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  28.67 
 
 		 412 aa  101  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  28.77 
 
 		 585 aa  99  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  24.5 
 
 		 999 aa  98.2  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  30.63 
 
 		 407 aa  97.8  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  22.09 
 
 		 1081 aa  97.4  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  29.59 
 
 		 422 aa  97.4  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  30.88 
 
 		 2172 aa  95.5  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2737  glucose sorbosone dehydrogenase  28.2 
 
 		 415 aa  95.1  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417309 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  27.44 
 
 		 411 aa  94.4  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  33.82 
 
 		 394 aa  94  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  33.82 
 
 		 369 aa  93.2  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  28.62 
 
 		 342 aa  92.4  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  31.12 
 
 		 360 aa  91.7  7e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  30.04 
 
 		 392 aa  91.3  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  34.15 
 
 		 410 aa  90.5  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.23 
 
 		 809 aa  91.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.29 
 
 		 570 aa  91.3  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  31.34 
 
 		 374 aa  89.7  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  31.34 
 
 		 374 aa  89.4  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  28.62 
 
 		 399 aa  89  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  27.99 
 
 		 388 aa  89.4  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  24.83 
 
 		 530 aa  89  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.13 
 
 		 729 aa  88.2  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.36 
 
 		 387 aa  87.4  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  28.26 
 
 		 430 aa  87.8  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  23.55 
 
 		 712 aa  87.4  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  29.33 
 
 		 387 aa  87  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  31.6 
 
 		 383 aa  86.7  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1788  glucose sorbosone dehydrogenase  30.48 
 
 		 391 aa  86.7  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0330731 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  27.63 
 
 		 391 aa  85.9  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  27.04 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  26.73 
 
 		 382 aa  85.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  28.42 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  27.99 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  29.28 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  27.04 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  26.87 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  24.27 
 
 		 1132 aa  85.1  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2694  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.79 
 
 		 520 aa  84.7  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439378  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  28.94 
 
 		 384 aa  84  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  26.56 
 
 		 383 aa  84.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  25.97 
 
 		 388 aa  84.3  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2262  glucose dehydrogenase  31.15 
 
 		 384 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  29.67 
 
 		 382 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4740  putative secreted glycosyl hydrolase  26.72 
 
 		 255 aa  83.2  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195293  hitchhiker  0.002769 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  25.9 
 
 		 387 aa  82.8  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  26.92 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  29.28 
 
 		 400 aa  82.4  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2666  glucose sorbosone dehydrogenase  29.82 
 
 		 395 aa  82.4  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0349598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2908  putative secreted glycosyl hydrolase  27.12 
 
 		 266 aa  82  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  29.66 
 
 		 400 aa  82  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7278  cytochrome c class I  48.05 
 
 		 138 aa  82  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  30.55 
 
 		 375 aa  81.6  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  30 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>