59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3566 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3566  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  652    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35008  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1544  hypothetical protein  25.78 
 
 		 326 aa  99.8  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0591  hypothetical protein  25.72 
 
 		 327 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4699  hypothetical protein  27.27 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.474373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.89 
 
 		 1200 aa  71.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.74 
 
 		 1503 aa  62.4  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.78 
 
 		 1265 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4538  hypothetical protein  28.37 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0275466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  27.98 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1804  hypothetical protein  26.38 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  24.9 
 
 		 1505 aa  58.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0975  hypothetical protein  28.8 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  24.71 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  23.3 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1906  hypothetical protein  25.71 
 
 		 233 aa  57  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  24.33 
 
 		 1444 aa  57  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7276  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1518  hypothetical protein  27.05 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6311  hypothetical protein  27.05 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.566642 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6969  hypothetical protein  26.57 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  27.21 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4740  putative secreted glycosyl hydrolase  23.86 
 
 		 255 aa  53.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195293  hitchhiker  0.002769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  25.5 
 
 		 392 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0069  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2908  putative secreted glycosyl hydrolase  24.68 
 
 		 266 aa  50.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  23.41 
 
 		 1143 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 232 aa  50.4  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.62 
 
 		 1274 aa  50.1  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5793  hypothetical protein  28.7 
 
 		 233 aa  49.7  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20450  hypothetical protein  27.18 
 
 		 234 aa  50.1  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4406  hypothetical protein  27.27 
 
 		 217 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192664  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  22.46 
 
 		 1138 aa  49.3  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1682  hypothetical protein  31.11 
 
 		 213 aa  49.3  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.08 
 
 		 1171 aa  49.3  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0085  hypothetical protein  26.7 
 
 		 232 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3453  hypothetical protein  27.27 
 
 		 217 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01580  hypothetical protein  27.32 
 
 		 248 aa  48.5  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3989  hypothetical protein  29.89 
 
 		 214 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  22.53 
 
 		 1142 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1863  hypothetical protein  28.49 
 
 		 213 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285265  normal  0.687336 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1192  hypothetical protein  25.1 
 
 		 228 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00959683  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0731  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 245 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  25.7 
 
 		 1182 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  25.51 
 
 		 1194 aa  47.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0067  hypothetical protein  28.11 
 
 		 232 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3102  hypothetical protein  28.98 
 
 		 216 aa  47  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0831  secreted glycosyl hydrolase  26.06 
 
 		 223 aa  46.6  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0120  hypothetical protein  28.25 
 
 		 221 aa  45.8  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  22.44 
 
 		 247 aa  45.8  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  23.28 
 
 		 275 aa  45.8  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  22.99 
 
 		 1151 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  22.62 
 
 		 1135 aa  44.3  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0136  hypothetical protein  24.74 
 
 		 225 aa  43.9  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0059  hypothetical protein  26.9 
 
 		 222 aa  43.5  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132757  decreased coverage  0.00597084 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2953  hypothetical protein  26.26 
 
 		 213 aa  43.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4608  hypothetical protein  22.67 
 
 		 258 aa  43.1  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.16 
 
 		 1180 aa  42.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1628  hypothetical protein  21.67 
 
 		 308 aa  42.4  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107421  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0811  hypothetical protein  20.99 
 
 		 245 aa  42.4  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.8275 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>