47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0120 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0120  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  439  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1600  hypothetical protein  56.62 
 
 
227 aa  252  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988724  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0067  hypothetical protein  52.81 
 
 
232 aa  244  8e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1192  hypothetical protein  54.82 
 
 
228 aa  239  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00959683  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20450  hypothetical protein  53.28 
 
 
234 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0085  hypothetical protein  48.92 
 
 
232 aa  230  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5793  hypothetical protein  54.67 
 
 
233 aa  229  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01580  hypothetical protein  48.92 
 
 
248 aa  229  3e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0975  hypothetical protein  49.79 
 
 
236 aa  223  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5101  hypothetical protein  51.17 
 
 
228 aa  216  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.204756  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4406  hypothetical protein  50.23 
 
 
217 aa  214  9e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192664  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3453  hypothetical protein  48.86 
 
 
217 aa  212  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3102  hypothetical protein  52.07 
 
 
216 aa  206  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0136  hypothetical protein  47.93 
 
 
225 aa  196  3e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2953  hypothetical protein  41.2 
 
 
213 aa  170  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3989  hypothetical protein  42.13 
 
 
214 aa  167  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1682  hypothetical protein  38.43 
 
 
213 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1863  hypothetical protein  37.5 
 
 
213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285265  normal  0.687336 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0465  hypothetical protein  39.91 
 
 
216 aa  156  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4188  hypothetical protein  35.32 
 
 
214 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6969  hypothetical protein  35.91 
 
 
220 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6311  hypothetical protein  35.91 
 
 
220 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.566642 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1518  hypothetical protein  35.91 
 
 
220 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3860  hypothetical protein  33.94 
 
 
214 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0231605  normal  0.114316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.33 
 
 
1265 aa  78.6  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.11 
 
 
1503 aa  75.5  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  28.27 
 
 
375 aa  68.2  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.08 
 
 
1274 aa  67  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  26.99 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.33 
 
 
1180 aa  59.3  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.49 
 
 
1171 aa  58.2  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0213  hypothetical protein  25.15 
 
 
223 aa  57  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0831  secreted glycosyl hydrolase  26.28 
 
 
223 aa  52.4  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1382  glycosyl hydrolase  22.3 
 
 
296 aa  50.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213541  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1906  hypothetical protein  24.52 
 
 
233 aa  50.1  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4526  sigma-70 factor  22.83 
 
 
255 aa  49.3  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  25.41 
 
 
275 aa  48.9  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.67 
 
 
1505 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  26.89 
 
 
285 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1804  hypothetical protein  25.26 
 
 
276 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3566  hypothetical protein  28.41 
 
 
314 aa  45.8  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35008  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  23.27 
 
 
1444 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2274  hypothetical protein  27.7 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.507054 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3256  hypothetical protein  26.41 
 
 
351 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  22.93 
 
 
1135 aa  42.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.21 
 
 
232 aa  42  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1220  sigma-70 factor  23.5 
 
 
260 aa  41.6  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0178676  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>