40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0975 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0975  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  485  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01580  hypothetical protein  81.28 
 
 
248 aa  404  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0085  hypothetical protein  79.06 
 
 
232 aa  387  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0067  hypothetical protein  76.6 
 
 
232 aa  384  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20450  hypothetical protein  66.53 
 
 
234 aa  321  5e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1192  hypothetical protein  63.25 
 
 
228 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00959683  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0120  hypothetical protein  49.79 
 
 
221 aa  204  9e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5793  hypothetical protein  47.21 
 
 
233 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1600  hypothetical protein  42.98 
 
 
227 aa  181  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988724  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5101  hypothetical protein  44.16 
 
 
228 aa  178  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.204756  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3453  hypothetical protein  39.32 
 
 
217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4406  hypothetical protein  39.32 
 
 
217 aa  172  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192664  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0136  hypothetical protein  40 
 
 
225 aa  161  7e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1682  hypothetical protein  39.32 
 
 
213 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1863  hypothetical protein  38.72 
 
 
213 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285265  normal  0.687336 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2953  hypothetical protein  37.61 
 
 
213 aa  153  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3102  hypothetical protein  37.87 
 
 
216 aa  151  8.999999999999999e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3989  hypothetical protein  36.32 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0465  hypothetical protein  33.19 
 
 
216 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4188  hypothetical protein  35.9 
 
 
214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3860  hypothetical protein  34.62 
 
 
214 aa  104  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0231605  normal  0.114316 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1518  hypothetical protein  33.33 
 
 
220 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6311  hypothetical protein  33.33 
 
 
220 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.566642 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6969  hypothetical protein  33.33 
 
 
220 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.83 
 
 
1265 aa  65.9  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  27.32 
 
 
219 aa  65.1  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.74 
 
 
1274 aa  59.7  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3566  hypothetical protein  28.8 
 
 
314 aa  57.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35008  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.91 
 
 
1503 aa  57  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0831  secreted glycosyl hydrolase  25.6 
 
 
223 aa  56.2  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.68 
 
 
1180 aa  55.5  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25 
 
 
1171 aa  52  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0213  hypothetical protein  25.32 
 
 
223 aa  51.6  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2558  hypothetical protein  23.73 
 
 
214 aa  50.4  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000292512  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1382  glycosyl hydrolase  26.29 
 
 
296 aa  47.8  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213541  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0811  hypothetical protein  19.55 
 
 
245 aa  47.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.8275 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  26.29 
 
 
279 aa  46.6  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2908  putative secreted glycosyl hydrolase  26.92 
 
 
266 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3256  hypothetical protein  26.32 
 
 
351 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4699  hypothetical protein  23.78 
 
 
243 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.474373  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>