57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3102 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3102  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  449  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4406  hypothetical protein  56.94 
 
 		 217 aa  254  8e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192664  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3453  hypothetical protein  56.94 
 
 		 217 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1682  hypothetical protein  54.17 
 
 		 213 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2953  hypothetical protein  54.63 
 
 		 213 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1863  hypothetical protein  53.24 
 
 		 213 aa  229  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285265  normal  0.687336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3989  hypothetical protein  53.7 
 
 		 214 aa  228  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1600  hypothetical protein  49.31 
 
 		 227 aa  195  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988724  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0465  hypothetical protein  45.66 
 
 		 216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0136  hypothetical protein  44.86 
 
 		 225 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0120  hypothetical protein  52.07 
 
 		 221 aa  180  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5793  hypothetical protein  45.33 
 
 		 233 aa  174  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20450  hypothetical protein  41.05 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0067  hypothetical protein  39.74 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4188  hypothetical protein  44.44 
 
 		 214 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1192  hypothetical protein  40 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00959683  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01580  hypothetical protein  38.43 
 
 		 248 aa  155  4e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3860  hypothetical protein  43.52 
 
 		 214 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0231605  normal  0.114316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5101  hypothetical protein  42.06 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.204756  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0085  hypothetical protein  37.55 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0975  hypothetical protein  37.87 
 
 		 236 aa  151  8e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6311  hypothetical protein  39.73 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.566642 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1518  hypothetical protein  39.73 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6969  hypothetical protein  39.27 
 
 		 220 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  29.33 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.96 
 
 		 1265 aa  75.5  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1220  sigma-70 factor  28.12 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0178676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0831  secreted glycosyl hydrolase  28.22 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.23 
 
 		 1274 aa  62.8  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.7 
 
 		 1503 aa  62.8  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  25.52 
 
 		 1444 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.26 
 
 		 1180 aa  55.5  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  25.71 
 
 		 392 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  25.79 
 
 		 275 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  25.39 
 
 		 1505 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  28.48 
 
 		 285 aa  53.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  23.57 
 
 		 1182 aa  53.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  24.36 
 
 		 375 aa  52.8  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1382  glycosyl hydrolase  30.07 
 
 		 296 aa  51.6  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213541  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1906  hypothetical protein  22.94 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  20.88 
 
 		 1138 aa  48.9  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3547  hypothetical protein  30.1 
 
 		 262 aa  48.5  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1804  hypothetical protein  25.73 
 
 		 276 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3566  hypothetical protein  28.98 
 
 		 314 aa  47  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35008  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0731  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 245 aa  47  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0382  hypothetical protein  29.23 
 
 		 245 aa  46.6  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7276  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.93 
 
 		 272 aa  46.2  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  24.87 
 
 		 279 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4526  sigma-70 factor  21.39 
 
 		 255 aa  45.1  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.85 
 
 		 1171 aa  45.1  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 800 aa  44.3  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  22 
 
 		 1135 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  23.98 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4699  hypothetical protein  31.15 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.474373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2274  hypothetical protein  28.7 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.507054 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0069  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.83 
 
 		 277 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>