205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0511 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  43.24 
 
 		 1503 aa  732    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  47.36 
 
 		 1180 aa  799    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  51.32 
 
 		 1171 aa  835    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  61.77 
 
 		 1274 aa  1597    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 1265 aa  2633    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.46 
 
 		 1306 aa  324  5e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0332  membrane-bound dehydrogenase domain protein  31.31 
 
 		 705 aa  243  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1564  membrane-bound dehydrogenase domain protein  31.1 
 
 		 1193 aa  215  3.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0358  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.82 
 
 		 712 aa  208  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0666  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.55 
 
 		 1181 aa  199  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4779  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.45 
 
 		 1162 aa  198  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1373  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.74 
 
 		 1149 aa  196  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5354  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.94 
 
 		 951 aa  188  6e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6338  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.22 
 
 		 957 aa  184  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1262  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.35 
 
 		 1068 aa  182  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4984  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28 
 
 		 1055 aa  177  9e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0279  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.87 
 
 		 1286 aa  172  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.624688  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0902  heme-binding protein  26.67 
 
 		 1139 aa  166  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4716  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.31 
 
 		 759 aa  160  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0863725  normal  0.0139154 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3985  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.87 
 
 		 852 aa  155  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188405  normal  0.0691409 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2734  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.96 
 
 		 1084 aa  148  8.000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.552836  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2449  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.17 
 
 		 762 aa  144  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.896022 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.02 
 
 		 1390 aa  143  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4998  cytochrome c class I  26.06 
 
 		 756 aa  141  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0614505  normal  0.826099 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3055  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.76 
 
 		 868 aa  138  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5000  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.18 
 
 		 749 aa  133  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.652472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5811  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.62 
 
 		 1040 aa  125  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3060  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.04 
 
 		 1027 aa  121  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.329582  normal  0.577758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0403  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.42 
 
 		 773 aa  118  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572265  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0029  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.87 
 
 		 1201 aa  110  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167421  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1100  blue (type 1) copper domain protein  37.85 
 
 		 673 aa  102  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303689  normal  0.203492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5487  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.62 
 
 		 1023 aa  99  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.181879 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  29.65 
 
 		 1439 aa  98.2  9e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1880  blue (type 1) copper domain protein  35.33 
 
 		 722 aa  96.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.459048 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  40.71 
 
 		 669 aa  96.3  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4406  hypothetical protein  31.4 
 
 		 217 aa  95.1  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192664  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3453  hypothetical protein  29.68 
 
 		 217 aa  94  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1600  hypothetical protein  33.19 
 
 		 227 aa  93.2  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988724  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0335  blue (type 1) copper domain protein  41.96 
 
 		 373 aa  91.7  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3707  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.78 
 
 		 968 aa  90.5  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1436  heme-binding protein  24.61 
 
 		 1058 aa  90.5  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1209  blue (type 1) copper domain protein  36 
 
 		 147 aa  85.9  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1863  hypothetical protein  27.52 
 
 		 213 aa  84.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285265  normal  0.687336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1682  hypothetical protein  27.98 
 
 		 213 aa  84.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1972  heme-binding protein  24.44 
 
 		 1110 aa  84  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1382  glycosyl hydrolase  32.2 
 
 		 296 aa  83.2  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213541  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  27.96 
 
 		 219 aa  82  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.93 
 
 		 436 aa  81.6  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2953  hypothetical protein  27.98 
 
 		 213 aa  80.9  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3989  hypothetical protein  34.81 
 
 		 214 aa  79.7  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  28.46 
 
 		 1151 aa  80.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0811  hypothetical protein  24.64 
 
 		 245 aa  79.3  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.8275 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0831  secreted glycosyl hydrolase  29.11 
 
 		 223 aa  79  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1172  blue (type 1) copper domain protein  35.96 
 
 		 358 aa  77  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1220  sigma-70 factor  27.43 
 
 		 260 aa  76.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0178676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6210  heme-binding protein  25.62 
 
 		 1141 aa  76.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3102  hypothetical protein  28.96 
 
 		 216 aa  75.5  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  28.57 
 
 		 1444 aa  75.1  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  28.15 
 
 		 285 aa  75.5  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2820  hypothetical protein  26.82 
 
 		 306 aa  74.3  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  hitchhiker  0.00217899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  24.11 
 
 		 1143 aa  73.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0327  blue (type 1) copper domain protein  40.87 
 
 		 164 aa  73.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0741181 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  27.54 
 
 		 375 aa  73.2  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  26.14 
 
 		 381 aa  72.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  26.89 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2465  heme-binding protein  23.98 
 
 		 1137 aa  72  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1518  hypothetical protein  28.76 
 
 		 220 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6311  hypothetical protein  28.76 
 
 		 220 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.566642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3112  blue (type1) copper domain-containing protein  36.59 
 
 		 159 aa  70.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 232 aa  69.7  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5793  hypothetical protein  30.05 
 
 		 233 aa  69.7  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2366  blue (type1) copper domain-containing protein  35.48 
 
 		 159 aa  69.3  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0881653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  31.2 
 
 		 161 aa  68.9  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  28.02 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6969  hypothetical protein  27.88 
 
 		 220 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0747  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  25.17 
 
 		 377 aa  67  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0136  hypothetical protein  27.05 
 
 		 225 aa  66.6  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01580  hypothetical protein  25.52 
 
 		 248 aa  66.2  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.59 
 
 		 478 aa  65.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0975  hypothetical protein  26.83 
 
 		 236 aa  65.9  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  25.63 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  25.11 
 
 		 1135 aa  65.5  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2909  azurin  36.21 
 
 		 165 aa  65.1  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 800 aa  64.7  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  26.85 
 
 		 1138 aa  64.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  25.27 
 
 		 279 aa  64.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2412  blue (type1) copper domain-containing protein  31.39 
 
 		 173 aa  64.3  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7276  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 272 aa  63.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  23.36 
 
 		 1505 aa  63.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0067  hypothetical protein  27.23 
 
 		 232 aa  64.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.14 
 
 		 379 aa  63.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  22.26 
 
 		 1194 aa  63.2  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5101  hypothetical protein  27.31 
 
 		 228 aa  63.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.204756  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0143  heme-binding protein  22.1 
 
 		 880 aa  63.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0874  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  26.45 
 
 		 357 aa  63.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3860  hypothetical protein  28.25 
 
 		 214 aa  63.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0231605  normal  0.114316 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1469  NHL repeat containing protein  25.33 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1906  hypothetical protein  22.32 
 
 		 233 aa  62  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0932  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  28.37 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0678662 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1944  L-sorbosone dehydrogenase  25.66 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358319  normal  0.0404039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>