115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3055 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3055  membrane-bound dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 868 aa  1790    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3060  membrane-bound dehydrogenase domain protein  52.16 
 
 		 1027 aa  942    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.329582  normal  0.577758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5811  membrane-bound dehydrogenase domain protein  51.49 
 
 		 1040 aa  890    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0029  membrane-bound dehydrogenase domain protein  42.59 
 
 		 1201 aa  643    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167421  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5487  membrane-bound dehydrogenase domain protein  36.36 
 
 		 1023 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.181879 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3707  membrane-bound dehydrogenase domain protein  35.35 
 
 		 968 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4779  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.44 
 
 		 1162 aa  185  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1373  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.75 
 
 		 1149 aa  162  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0666  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.45 
 
 		 1181 aa  159  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.97 
 
 		 1171 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1972  heme-binding protein  29.31 
 
 		 1110 aa  139  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.64 
 
 		 1265 aa  139  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.01 
 
 		 1274 aa  135  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1262  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.5 
 
 		 1068 aa  134  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4984  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.1 
 
 		 1055 aa  128  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.3 
 
 		 1306 aa  127  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.27 
 
 		 1180 aa  127  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1564  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.6 
 
 		 1193 aa  122  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0279  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.33 
 
 		 1286 aa  115  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.624688  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26 
 
 		 1390 aa  112  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0332  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.84 
 
 		 705 aa  111  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0902  heme-binding protein  24.56 
 
 		 1139 aa  107  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.44 
 
 		 1503 aa  104  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0358  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.43 
 
 		 712 aa  103  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2734  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.16 
 
 		 1084 aa  102  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.552836  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  25.81 
 
 		 1439 aa  100  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4716  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.26 
 
 		 759 aa  98.6  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0863725  normal  0.0139154 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6338  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.33 
 
 		 957 aa  97.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4620  heme-binding protein  23.89 
 
 		 1143 aa  95.1  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6210  heme-binding protein  23.88 
 
 		 1141 aa  90.1  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0403  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.71 
 
 		 773 aa  88.6  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5354  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.12 
 
 		 951 aa  86.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1153  membrane-bound dehydrogenase domain protein  20.9 
 
 		 864 aa  82.8  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3985  membrane-bound dehydrogenase domain protein  35.94 
 
 		 852 aa  83.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188405  normal  0.0691409 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2449  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.91 
 
 		 762 aa  81.6  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.896022 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4998  cytochrome c class I  22.74 
 
 		 756 aa  79.3  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0614505  normal  0.826099 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1436  heme-binding protein  22.68 
 
 		 1058 aa  78.2  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  25.55 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2465  heme-binding protein  21.67 
 
 		 1137 aa  71.2  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6252  heme-binding protein  22.98 
 
 		 874 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0965  heme-binding protein  22.41 
 
 		 902 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.632027  normal  0.0425648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5000  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.11 
 
 		 749 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.652472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1407  heme-binding protein  26.39 
 
 		 1142 aa  65.9  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258582  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1469  NHL repeat containing protein  24.69 
 
 		 439 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  26.75 
 
 		 546 aa  62  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1944  L-sorbosone dehydrogenase  23.93 
 
 		 433 aa  62  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358319  normal  0.0404039 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  25.39 
 
 		 436 aa  61.6  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2505  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  23.96 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.867319  normal  0.0176215 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10028  L-sorbosone dehydrogenase  23.5 
 
 		 421 aa  60.5  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1682  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  25.89 
 
 		 428 aa  60.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  24.85 
 
 		 381 aa  60.1  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  24.34 
 
 		 363 aa  59.7  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  25.44 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2856  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  23.77 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.656611  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  21.48 
 
 		 460 aa  58.2  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0422  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  23.55 
 
 		 423 aa  57.4  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0496  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  27.08 
 
 		 428 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0409715  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2815  hypothetical protein  36.67 
 
 		 363 aa  55.1  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2597  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  22.77 
 
 		 380 aa  55.1  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  hitchhiker  0.000753763 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2435  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  23.18 
 
 		 369 aa  54.7  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.216598  hitchhiker  0.00191889 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2684  hypothetical protein  35.56 
 
 		 363 aa  54.7  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  24.48 
 
 		 384 aa  54.3  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2860  L-sorbosone dehydrogenase  24.6 
 
 		 389 aa  53.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.597888  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47795  predicted protein  27.84 
 
 		 523 aa  53.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1660  L-sorbosone dehydrogenase, putative  24.6 
 
 		 419 aa  52.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2921  L-sorbosone dehydrogenase  24.6 
 
 		 372 aa  52.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0941  L-sorbosone dehydrogenase, putative  23.22 
 
 		 361 aa  52.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0785845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47060  L-sorbosone dehydrogenase  22.15 
 
 		 440 aa  52.4  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0907  cytochrome c class I  24.71 
 
 		 621 aa  52.4  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.433634 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2969  hypothetical protein  24.6 
 
 		 355 aa  52  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  24.57 
 
 		 371 aa  52  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1723  heme-binding protein  23.04 
 
 		 1077 aa  51.6  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.789867  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0148  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  27.27 
 
 		 423 aa  51.6  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.392107 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1406  L-sorbosone dehydrogenase  24.08 
 
 		 448 aa  51.2  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.685553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1979  NHL repeat-containing protein  21.91 
 
 		 444 aa  51.2  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.902626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1171  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.5 
 
 		 491 aa  51.6  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4182  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  25.39 
 
 		 379 aa  50.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0709  L-sorbosone dehydrogenase  23.91 
 
 		 447 aa  50.4  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.570753 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0944  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  27.46 
 
 		 379 aa  50.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0948  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.24 
 
 		 379 aa  50.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.168955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0795  L-sorbosone dehydrogenase  22.9 
 
 		 447 aa  49.7  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2392  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  23.44 
 
 		 448 aa  49.7  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0874  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  28.06 
 
 		 357 aa  50.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0143  heme-binding protein  22.86 
 
 		 880 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3494  L-sorbosone dehydrogenase  23.33 
 
 		 446 aa  49.3  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0961281  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  23.96 
 
 		 617 aa  49.3  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2235  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  25.58 
 
 		 379 aa  49.3  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1027  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  25 
 
 		 379 aa  49.3  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2740  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  27.53 
 
 		 418 aa  48.9  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120744  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3308  heme-binding protein  23.64 
 
 		 924 aa  48.9  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1399  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  27.53 
 
 		 418 aa  48.5  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5447  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  25.38 
 
 		 424 aa  48.5  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2788  NHL repeat-containing protein  24.62 
 
 		 349 aa  48.5  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0287  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  25.21 
 
 		 419 aa  48.5  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.473358 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3015  oxidoreductase, putative  24.64 
 
 		 396 aa  48.5  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1726  L-sorbosone dehydrogenase, putative  25.62 
 
 		 362 aa  47.8  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0932  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  26.53 
 
 		 357 aa  47  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0678662 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3687  L-sorbosone dehydrogenase  29 
 
 		 430 aa  47  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.816344  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0589  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  25.4 
 
 		 379 aa  47.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3094  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  25.85 
 
 		 427 aa  47.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.379716 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>