182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47795 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_47795  predicted protein  100 
 
 		 523 aa  1072    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3015  oxidoreductase, putative  28.85 
 
 		 396 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3234  NHL repeat containing protein  29.79 
 
 		 446 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  32.77 
 
 		 460 aa  128  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2145  L-sorbosone dehydrogenase  29.43 
 
 		 423 aa  127  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3122  L-sorbosone dehydrogenase  30.63 
 
 		 418 aa  127  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.68 
 
 		 436 aa  126  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0627  glucose sorbosone dehydrogenase  28.5 
 
 		 411 aa  123  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.308519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1406  L-sorbosone dehydrogenase  30.36 
 
 		 448 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.685553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  29.05 
 
 		 384 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  28.57 
 
 		 363 aa  121  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47060  L-sorbosone dehydrogenase  31.53 
 
 		 440 aa  120  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  28.15 
 
 		 617 aa  120  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2727  L-sorbosone dehydrogenase  31.25 
 
 		 438 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4522  glucose sorbosone dehydrogenase  31.15 
 
 		 423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  29.75 
 
 		 381 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1949  putative L-sorbosone dehydrogenase  28.91 
 
 		 429 aa  117  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220876  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0889  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.57 
 
 		 403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.167597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1033  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.57 
 
 		 403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.877554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2541  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  27.54 
 
 		 391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2048  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.98 
 
 		 367 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.228554  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2856  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.72 
 
 		 420 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.656611  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0504  L-sorbosone dehydrogenase  30.75 
 
 		 434 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2980  oxidoreductase, putative  30.69 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0257  putative glucose/sorbosone dehydrogenase; putative peptide signal  28.22 
 
 		 446 aa  111  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2488  glucose sorbosone dehydrogenase  28.25 
 
 		 410 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583653  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0747  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  26.83 
 
 		 377 aa  110  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03080  L-sorbosone dehydrogenase  30.62 
 
 		 445 aa  110  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2920  L-sorbosone dehydrogenase  29.97 
 
 		 448 aa  109  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00641513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0906  L-sorbosone dehydrogenase  28.21 
 
 		 447 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0508  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  25.82 
 
 		 371 aa  109  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760317  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.68 
 
 		 371 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3631  L-sorbosone dehydrogenase  31.34 
 
 		 442 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000516616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4899  L-sorbosone dehydrogenase  30.4 
 
 		 447 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0395  L-sorbosone dehydrogenase  30.4 
 
 		 446 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6326  putative L-sorbosone dehydrogenase  30.46 
 
 		 436 aa  109  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1723  L-sorbosone dehydrogenase  30.31 
 
 		 435 aa  108  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000227847 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2392  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.9 
 
 		 448 aa  108  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1979  NHL repeat-containing protein  30.23 
 
 		 444 aa  107  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.902626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1944  L-sorbosone dehydrogenase  28.92 
 
 		 433 aa  107  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358319  normal  0.0404039 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0732  L-sorbosone dehydrogenase  28.53 
 
 		 452 aa  107  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1806  L-sorbosone dehydrogenase  29.31 
 
 		 465 aa  107  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780322  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3024  L-sorbosone dehydrogenase  30.48 
 
 		 448 aa  106  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.78 
 
 		 379 aa  106  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1108  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  28.12 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2302  L-sorbosone dehydrogenase  30 
 
 		 430 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  0.586035 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1065  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  30.21 
 
 		 380 aa  105  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2420  L-sorbosone dehydrogenase  30.59 
 
 		 461 aa  105  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.840322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2734  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.26 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0228089  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2788  NHL repeat-containing protein  26.72 
 
 		 349 aa  105  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3687  L-sorbosone dehydrogenase  29.97 
 
 		 430 aa  104  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.816344  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0511  L-sorbosone dehydrogenase  28.38 
 
 		 430 aa  104  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1954  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.53 
 
 		 433 aa  104  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.051744  normal  0.930845 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  29.05 
 
 		 642 aa  104  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1787  L-sorbosone dehydrogenase  30.9 
 
 		 430 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409847  hitchhiker  0.00688825 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2796  L-sorbosone dehydrogenase  29.38 
 
 		 448 aa  103  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2815  hypothetical protein  24.71 
 
 		 363 aa  103  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0941  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.14 
 
 		 361 aa  103  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0785845  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0932  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  29.64 
 
 		 357 aa  103  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0678662 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1639  L-sorbosone dehydrogenase  30.37 
 
 		 437 aa  103  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1660  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.41 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0795  L-sorbosone dehydrogenase  30.62 
 
 		 447 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6140  L-sorbosone dehydrogenase  25.88 
 
 		 457 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2479  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.4 
 
 		 438 aa  103  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000414902 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10028  L-sorbosone dehydrogenase  28.83 
 
 		 421 aa  103  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4119  L-sorbosone dehydrogenase  29.38 
 
 		 448 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0709  L-sorbosone dehydrogenase  28.98 
 
 		 447 aa  102  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.570753 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3908  hypothetical protein  28.53 
 
 		 429 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.724834  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2067  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  29.58 
 
 		 456 aa  101  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2684  hypothetical protein  24.94 
 
 		 363 aa  100  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1726  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.83 
 
 		 362 aa  100  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2827  L-sorbosone dehydrogenase  29.2 
 
 		 430 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3494  L-sorbosone dehydrogenase  32.1 
 
 		 446 aa  100  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0961281  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3613  L-sorbosone dehydrogenase  29.2 
 
 		 430 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  27.63 
 
 		 546 aa  99.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5447  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  26.92 
 
 		 424 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3110  L-sorbosone dehydrogenase  29.2 
 
 		 430 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0900  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  26.67 
 
 		 361 aa  99  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0737  L-sorbosone dehydrogenase  30.25 
 
 		 454 aa  98.6  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.684537  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0415  NHL repeat-containing protein  29.35 
 
 		 416 aa  98.2  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.96309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1425  NHL repeat-containing protein  26.85 
 
 		 446 aa  98.2  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2660  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  25.51 
 
 		 388 aa  98.6  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2746  L-sorbosone dehydrogenase  28.88 
 
 		 438 aa  97.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.298612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1270  L-sorbosone dehydrogenase  28.09 
 
 		 454 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1469  NHL repeat containing protein  28.65 
 
 		 439 aa  97.1  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2505  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  26.17 
 
 		 369 aa  97.1  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.867319  normal  0.0176215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3647  L-sorbosone dehydrogenase  26.52 
 
 		 434 aa  97.1  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000551723  normal  0.19553 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2860  L-sorbosone dehydrogenase  29.62 
 
 		 389 aa  97.1  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.597888  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1588  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  27.92 
 
 		 419 aa  96.7  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0027  cytochrome c class I  27.75 
 
 		 548 aa  95.9  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.16509  normal  0.0410464 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2921  L-sorbosone dehydrogenase  29.62 
 
 		 372 aa  96.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2969  hypothetical protein  27.74 
 
 		 355 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2597  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  26.17 
 
 		 380 aa  95.9  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  hitchhiker  0.000753763 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4756  putative membrane-anchored oxidoreductase  29.01 
 
 		 514 aa  95.9  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.931311  normal  0.0309571 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2218  NHL repeat-containing protein  26.4 
 
 		 430 aa  95.1  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.493276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0948  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.29 
 
 		 379 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.168955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0589  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  29.33 
 
 		 379 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1068  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.33 
 
 		 379 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0310832  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3042  L-sorbosone dehydrogenase, putative  24.53 
 
 		 391 aa  94.4  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  27.5 
 
 		 438 aa  94.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>