68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0143 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0143  heme-binding protein  100 
 
 		 880 aa  1818    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6252  heme-binding protein  67.8 
 
 		 874 aa  1262    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  37.52 
 
 		 1439 aa  424  1e-117  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2465  heme-binding protein  26 
 
 		 1137 aa  107  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0029  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.2 
 
 		 1201 aa  103  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167421  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6210  heme-binding protein  25.59 
 
 		 1141 aa  102  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1723  heme-binding protein  22.95 
 
 		 1077 aa  97.8  8e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.789867  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4620  heme-binding protein  25.64 
 
 		 1143 aa  95.1  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5811  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.88 
 
 		 1040 aa  93.6  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1972  heme-binding protein  26.49 
 
 		 1110 aa  90.1  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5487  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.84 
 
 		 1023 aa  89  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.181879 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3060  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.37 
 
 		 1027 aa  85.1  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.329582  normal  0.577758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3707  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.85 
 
 		 968 aa  84.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1436  heme-binding protein  25.77 
 
 		 1058 aa  83.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1373  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.79 
 
 		 1149 aa  82.8  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4779  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.56 
 
 		 1162 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1407  heme-binding protein  28.91 
 
 		 1142 aa  76.3  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258582  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1153  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.23 
 
 		 864 aa  74.3  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1034  heme-binding protein  25.16 
 
 		 898 aa  73.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737373  normal  0.0957421 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0666  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.25 
 
 		 1181 aa  73.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0279  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.03 
 
 		 1286 aa  68.2  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.624688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.44 
 
 		 1265 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1564  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25 
 
 		 1193 aa  67  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.16 
 
 		 436 aa  66.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3737  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  24.83 
 
 		 466 aa  65.1  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0965  heme-binding protein  28.46 
 
 		 902 aa  64.3  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.632027  normal  0.0425648 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0902  heme-binding protein  26.14 
 
 		 1139 aa  63.5  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4536  heme-binding protein  26.77 
 
 		 168 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.756231 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2734  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.05 
 
 		 1084 aa  62.8  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.552836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.51 
 
 		 1274 aa  62.4  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3308  heme-binding protein  28.46 
 
 		 924 aa  61.2  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.34 
 
 		 1180 aa  58.2  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  23.46 
 
 		 379 aa  57  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3055  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.86 
 
 		 868 aa  57.4  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  24.58 
 
 		 384 aa  55.5  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.68 
 
 		 1390 aa  55.1  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  22.93 
 
 		 371 aa  55.1  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2488  glucose sorbosone dehydrogenase  29.5 
 
 		 410 aa  55.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583653  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2660  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.77 
 
 		 388 aa  54.7  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0146  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  27.09 
 
 		 438 aa  54.7  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.699108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  25.55 
 
 		 460 aa  54.7  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0422  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  24.92 
 
 		 423 aa  53.9  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  24.29 
 
 		 381 aa  53.9  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  21.26 
 
 		 1503 aa  52.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  25.87 
 
 		 363 aa  52  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000245782  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 		 330 aa  48.9  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0709  L-sorbosone dehydrogenase  23.53 
 
 		 447 aa  48.9  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.570753 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.07 
 
 		 487 aa  48.5  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.454131  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4716  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.82 
 
 		 759 aa  48.5  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0863725  normal  0.0139154 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2856  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  24.86 
 
 		 420 aa  48.1  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.656611  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4522  glucose sorbosone dehydrogenase  26.05 
 
 		 423 aa  48.5  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3378  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  26.45 
 
 		 422 aa  48.1  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2541  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  23.26 
 
 		 391 aa  48.1  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6338  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.48 
 
 		 957 aa  47.8  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2082  putative sorbosone/glucose dehydrogenase  30.09 
 
 		 419 aa  47.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0134  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  28.28 
 
 		 427 aa  47.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0143  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  28.28 
 
 		 427 aa  47.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  0.832483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0124  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  28.28 
 
 		 427 aa  47.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0697  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  25.94 
 
 		 443 aa  47.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  33.67 
 
 		 330 aa  47  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.34 
 
 		 1306 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2740  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  31.86 
 
 		 418 aa  46.6  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120744  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0358  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.13 
 
 		 712 aa  47  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1399  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  31.86 
 
 		 418 aa  45.8  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0332  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.05 
 
 		 705 aa  45.4  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2980  oxidoreductase, putative  26.43 
 
 		 398 aa  44.7  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1623  L-sorbosone dehydrogenase  25.47 
 
 		 420 aa  44.7  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.417413 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2978  putative membrane-bound dehydrogenase  24.28 
 
 		 394 aa  44.7  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0356498 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>