85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4391 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  100 
 
 		 487 aa  967    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.454131  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3063  NHL repeat containing protein  55.79 
 
 		 488 aa  524  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.440395 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3061  NHL repeat containing protein  44.3 
 
 		 433 aa  340  2.9999999999999998e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2816  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.8 
 
 		 612 aa  311  2e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7910  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.28 
 
 		 525 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0157522  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1899  hypothetical protein  27.31 
 
 		 428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317595  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1618  hypothetical protein  27.68 
 
 		 428 aa  130  6e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0613735  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3234  NHL repeat containing protein  32.85 
 
 		 446 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2980  oxidoreductase, putative  24.94 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  28.38 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000245782  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4756  putative membrane-anchored oxidoreductase  27.25 
 
 		 514 aa  57.4  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.931311  normal  0.0309571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  26.42 
 
 		 546 aa  57  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47060  L-sorbosone dehydrogenase  29.38 
 
 		 440 aa  55.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2748  putative L-sorbosone dehydrogenase  27 
 
 		 437 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2392  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.41 
 
 		 448 aa  55.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0906  L-sorbosone dehydrogenase  27.47 
 
 		 447 aa  54.3  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1425  NHL repeat-containing protein  27.43 
 
 		 446 aa  53.9  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0889  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.82 
 
 		 403 aa  53.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.167597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1033  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.82 
 
 		 403 aa  53.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.877554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2827  L-sorbosone dehydrogenase  24.41 
 
 		 430 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4522  glucose sorbosone dehydrogenase  30.5 
 
 		 423 aa  52.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0709  L-sorbosone dehydrogenase  32.61 
 
 		 447 aa  52.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.570753 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  28.63 
 
 		 363 aa  51.2  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1406  L-sorbosone dehydrogenase  29.86 
 
 		 448 aa  51.2  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.685553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  27.9 
 
 		 438 aa  50.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  25.61 
 
 		 1439 aa  50.8  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2302  L-sorbosone dehydrogenase  24.59 
 
 		 430 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  0.586035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1270  L-sorbosone dehydrogenase  31.13 
 
 		 454 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1954  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  24.87 
 
 		 433 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.051744  normal  0.930845 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0415  NHL repeat-containing protein  24.5 
 
 		 416 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.96309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0795  L-sorbosone dehydrogenase  34.91 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1944  L-sorbosone dehydrogenase  29.09 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358319  normal  0.0404039 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5608  putative L-sorbosone dehydrogenase protein  30.07 
 
 		 525 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.759477  hitchhiker  0.00328711 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1781  putative membrane-anchored oxidoreductase, L-sorbosone dehydrogenase  30.07 
 
 		 485 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.368311  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3494  L-sorbosone dehydrogenase  32.08 
 
 		 446 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0961281  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0732  L-sorbosone dehydrogenase  35.48 
 
 		 452 aa  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0143  heme-binding protein  29.07 
 
 		 880 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10028  L-sorbosone dehydrogenase  32.22 
 
 		 421 aa  48.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0781  L-sorbosone dehydrogenase  24.38 
 
 		 473 aa  48.5  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6326  putative L-sorbosone dehydrogenase  31.53 
 
 		 436 aa  48.5  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2067  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  26.67 
 
 		 456 aa  48.5  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0428  putative membrane-anchored oxidoreductase  30.07 
 
 		 485 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1231  NHL repeat-containing protein  25.35 
 
 		 1049 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.001634  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  24.15 
 
 		 406 aa  47.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2796  L-sorbosone dehydrogenase  32.11 
 
 		 448 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1723  L-sorbosone dehydrogenase  34 
 
 		 435 aa  48.1  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000227847 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03080  L-sorbosone dehydrogenase  37.35 
 
 		 445 aa  48.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  26.05 
 
 		 353 aa  47.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4899  L-sorbosone dehydrogenase  29.38 
 
 		 447 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3024  L-sorbosone dehydrogenase  32.11 
 
 		 448 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4727  glucose sorbosone dehydrogenase  29.17 
 
 		 403 aa  47.4  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635813  normal  0.114158 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  30.77 
 
 		 642 aa  47.4  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1639  L-sorbosone dehydrogenase  33.67 
 
 		 437 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  34.09 
 
 		 617 aa  47.4  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  28.3 
 
 		 460 aa  47  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6252  heme-binding protein  27.39 
 
 		 874 aa  47  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0148  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  26.33 
 
 		 423 aa  47  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.392107 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1171  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.64 
 
 		 491 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0336  hypothetical protein  33.64 
 
 		 502 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0496  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  29.05 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0409715  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1707  L-sorbosone dehydrogenase  31.53 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  37.63 
 
 		 366 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0961  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  36.84 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0737  L-sorbosone dehydrogenase  24.7 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.684537  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2856  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.11 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.656611  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  26.1 
 
 		 410 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0146  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  28.51 
 
 		 438 aa  45.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.699108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0627  glucose sorbosone dehydrogenase  25.14 
 
 		 411 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.308519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1823  glucose sorbosone dehydrogenase  34.48 
 
 		 396 aa  44.7  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1564  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.03 
 
 		 1193 aa  44.7  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2488  glucose sorbosone dehydrogenase  26.16 
 
 		 410 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583653  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0279  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.23 
 
 		 1286 aa  44.3  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.624688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2014  glucose sorbosone dehydrogenase  34.48 
 
 		 396 aa  44.3  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2640  putative L-sorbosone dehydrogenase  32.11 
 
 		 451 aa  44.3  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.532913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2727  L-sorbosone dehydrogenase  39.71 
 
 		 438 aa  43.9  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1682  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  28.64 
 
 		 428 aa  44.3  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0697  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  38.75 
 
 		 443 aa  44.3  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5064  NHL repeat-containing protein  28.49 
 
 		 422 aa  43.9  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409782  hitchhiker  0.00484678 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2920  L-sorbosone dehydrogenase  32.69 
 
 		 448 aa  43.9  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00641513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  30.77 
 
 		 410 aa  43.9  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1469  NHL repeat containing protein  26.17 
 
 		 439 aa  43.5  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2978  putative membrane-bound dehydrogenase  28.03 
 
 		 394 aa  43.5  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0356498 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.22 
 
 		 436 aa  43.5  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0395  L-sorbosone dehydrogenase  39.71 
 
 		 446 aa  43.5  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1949  putative L-sorbosone dehydrogenase  34.57 
 
 		 429 aa  43.5  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220876  normal  0.0233065 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>