95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0353 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 1390 aa  2873    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4984  membrane-bound dehydrogenase domain protein  36.65 
 
 		 1055 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1262  membrane-bound dehydrogenase domain protein  36.82 
 
 		 1068 aa  489  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  34.33 
 
 		 1306 aa  462  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0902  heme-binding protein  35.57 
 
 		 1139 aa  445  1e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4779  membrane-bound dehydrogenase domain protein  33.12 
 
 		 1162 aa  258  5e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1373  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.02 
 
 		 1149 aa  241  5e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0666  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.29 
 
 		 1181 aa  229  4e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.66 
 
 		 1274 aa  154  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.02 
 
 		 1265 aa  143  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.43 
 
 		 1180 aa  131  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5811  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.58 
 
 		 1040 aa  125  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.36 
 
 		 1171 aa  125  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0332  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.94 
 
 		 705 aa  121  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3707  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.36 
 
 		 968 aa  120  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1100  blue (type 1) copper domain protein  43.22 
 
 		 673 aa  115  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303689  normal  0.203492 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1564  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.04 
 
 		 1193 aa  112  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3055  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.2 
 
 		 868 aa  112  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3060  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.08 
 
 		 1027 aa  109  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.329582  normal  0.577758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5354  membrane-bound dehydrogenase domain protein  31.33 
 
 		 951 aa  107  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6338  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.6 
 
 		 957 aa  105  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.93 
 
 		 1503 aa  103  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0335  blue (type 1) copper domain protein  37.88 
 
 		 373 aa  103  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0029  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.26 
 
 		 1201 aa  100  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167421  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  40.34 
 
 		 669 aa  98.2  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3229  protein of unknown function DUF1549  40.85 
 
 		 1171 aa  93.2  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0358  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.8 
 
 		 712 aa  90.9  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3308  heme-binding protein  28.09 
 
 		 924 aa  91.3  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1880  blue (type 1) copper domain protein  38.66 
 
 		 722 aa  91.3  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.459048 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  37.41 
 
 		 818 aa  89.4  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2734  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.76 
 
 		 1084 aa  89  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.552836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0279  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.15 
 
 		 1286 aa  89  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.624688  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1972  heme-binding protein  24.29 
 
 		 1110 aa  88.2  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1172  blue (type 1) copper domain protein  33.86 
 
 		 358 aa  85.9  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5487  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.14 
 
 		 1023 aa  84.3  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.181879 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4716  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.18 
 
 		 759 aa  81.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0863725  normal  0.0139154 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0403  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.89 
 
 		 773 aa  80.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1209  blue (type 1) copper domain protein  34.96 
 
 		 147 aa  79.7  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1723  heme-binding protein  30.9 
 
 		 1077 aa  77.8  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.789867  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2909  azurin  36.88 
 
 		 165 aa  77.8  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1034  heme-binding protein  27.41 
 
 		 898 aa  73.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737373  normal  0.0957421 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0965  heme-binding protein  25.14 
 
 		 902 aa  73.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.632027  normal  0.0425648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4476  Alpha-L-fucosidase  45.24 
 
 		 731 aa  68.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766125  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2412  blue (type1) copper domain-containing protein  34.75 
 
 		 173 aa  68.9  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2366  blue (type1) copper domain-containing protein  37.6 
 
 		 159 aa  67  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0881653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1407  heme-binding protein  28.07 
 
 		 1142 aa  66.6  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258582  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0665  hypothetical protein  26.87 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0327  blue (type 1) copper domain protein  37.19 
 
 		 164 aa  65.9  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0741181 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1374  lipolytic protein G-D-S-L family  26.89 
 
 		 410 aa  64.3  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.221741 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4620  heme-binding protein  25.06 
 
 		 1143 aa  63.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3112  blue (type1) copper domain-containing protein  35.48 
 
 		 159 aa  63.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1153  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.32 
 
 		 864 aa  62.4  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3985  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.48 
 
 		 852 aa  62  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188405  normal  0.0691409 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1436  heme-binding protein  30.92 
 
 		 1058 aa  60.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  28.83 
 
 		 1439 aa  60.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1997  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.18 
 
 		 541 aa  59.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4778  lipolytic protein G-D-S-L family  28.18 
 
 		 417 aa  59.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4998  cytochrome c class I  21.99 
 
 		 756 aa  59.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0614505  normal  0.826099 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  28.35 
 
 		 161 aa  58.9  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6210  heme-binding protein  23.5 
 
 		 1141 aa  58.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2449  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.38 
 
 		 762 aa  58.2  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.896022 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4926  azurin  31.09 
 
 		 150 aa  57.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000893264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6252  heme-binding protein  25.95 
 
 		 874 aa  57.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5000  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.7 
 
 		 749 aa  56.6  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.652472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4662  azurin  31.09 
 
 		 150 aa  56.2  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0388565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0143  heme-binding protein  25.68 
 
 		 880 aa  55.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1802  blue (type1) copper domain-containing protein  31.67 
 
 		 179 aa  55.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1156  lipolytic protein G-D-S-L family  31.37 
 
 		 266 aa  54.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4536  heme-binding protein  23.72 
 
 		 168 aa  52.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.756231 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.61 
 
 		 831 aa  52  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4923  azurin  27.97 
 
 		 136 aa  50.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0938  blue (type1) copper domain-containing protein  31.9 
 
 		 157 aa  50.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000352291  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2465  heme-binding protein  22.92 
 
 		 1137 aa  50.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4870  azurin  29.41 
 
 		 149 aa  49.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4748  azurin  29.41 
 
 		 150 aa  49.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0809  azurin precursor  33.9 
 
 		 158 aa  49.3  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3649  azurin  32.76 
 
 		 158 aa  48.9  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127621  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3581  azurin  32.76 
 
 		 158 aa  48.9  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0658  azurin  32.76 
 
 		 158 aa  48.9  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.998691  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3772  azurin  32.76 
 
 		 158 aa  48.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  31.91 
 
 		 287 aa  48.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  28.09 
 
 		 460 aa  48.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0591  blue (type1) copper domain-containing protein  25.86 
 
 		 148 aa  48.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65000  azurin precursor  27.59 
 
 		 148 aa  48.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3212  coagulation factor 5/8 type-like  30.19 
 
 		 425 aa  47.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5648  azurin precursor  27.59 
 
 		 148 aa  47.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3478  blue (type1) copper domain-containing protein  32.76 
 
 		 158 aa  46.6  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3737  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  28 
 
 		 466 aa  46.6  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3180  azurin  33.62 
 
 		 158 aa  47  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2640  putative L-sorbosone dehydrogenase  26.24 
 
 		 451 aa  46.2  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.532913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3308  blue (type1) copper domain-containing protein  31.03 
 
 		 158 aa  46.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0645  blue (type1) copper domain-containing protein  31.03 
 
 		 158 aa  46.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.478569 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4226  azurin  40 
 
 		 152 aa  45.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.151542 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2435  azurin  34.12 
 
 		 155 aa  45.1  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.557296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1833  blue (type 1) copper domain protein  25.76 
 
 		 241 aa  45.1  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.749286  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>