51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0809 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0809  azurin precursor  100 
 
 
158 aa  322  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3649  azurin  87.9 
 
 
158 aa  283  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127621  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0658  azurin  87.9 
 
 
158 aa  283  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.998691  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3772  azurin  87.9 
 
 
158 aa  283  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3581  azurin  87.9 
 
 
158 aa  283  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3478  blue (type1) copper domain-containing protein  94.3 
 
 
158 aa  281  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3308  blue (type1) copper domain-containing protein  93.04 
 
 
158 aa  278  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0645  blue (type1) copper domain-containing protein  93.04 
 
 
158 aa  278  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.478569 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3180  azurin  85.99 
 
 
158 aa  256  6e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0938  blue (type1) copper domain-containing protein  78.91 
 
 
157 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000352291  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3740  azurin  65.84 
 
 
162 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05169  azurin  59.18 
 
 
150 aa  175  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001298  azurin  58.5 
 
 
150 aa  174  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01601  azurin precursor  57.66 
 
 
149 aa  173  9e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21134  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0658  azurin  59.38 
 
 
149 aa  169  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000453216 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0591  blue (type1) copper domain-containing protein  49.67 
 
 
148 aa  168  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4226  azurin  55.24 
 
 
152 aa  167  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.151542 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4923  azurin  54.55 
 
 
136 aa  166  8e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2435  azurin  56.15 
 
 
155 aa  164  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.557296  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65000  azurin precursor  52.76 
 
 
148 aa  157  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5648  azurin precursor  51.18 
 
 
148 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0546  azurin precursor  45.7 
 
 
148 aa  152  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.148254  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0210  blue (type1) copper domain-containing protein  49.3 
 
 
149 aa  147  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0250042  normal  0.405619 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1535  azurin  56.35 
 
 
153 aa  143  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0556  blue (type1) copper domain-containing protein  43.84 
 
 
199 aa  142  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.73332 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1745  electron transfer protein azurin I  47.71 
 
 
151 aa  140  7e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3289  azurin  50.36 
 
 
149 aa  139  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.949678  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1672  azurin  45.39 
 
 
151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4662  azurin  43.33 
 
 
150 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0388565 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4748  azurin  43.33 
 
 
150 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4870  azurin  42.11 
 
 
149 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00722252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4926  azurin  42 
 
 
150 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000893264 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4088  azurin  51.94 
 
 
149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0681809  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02282  azurin  45.19 
 
 
149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2909  azurin  49.59 
 
 
165 aa  105  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2412  blue (type1) copper domain-containing protein  41.73 
 
 
173 aa  93.2  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  37.01 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1802  blue (type1) copper domain-containing protein  35.2 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0327  blue (type 1) copper domain protein  36.75 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0741181 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  30 
 
 
669 aa  61.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  31.43 
 
 
287 aa  60.5  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  37.04 
 
 
1306 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  36.07 
 
 
1265 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1172  blue (type 1) copper domain protein  31.85 
 
 
358 aa  55.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1100  blue (type 1) copper domain protein  29.41 
 
 
673 aa  54.7  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303689  normal  0.203492 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1209  blue (type 1) copper domain protein  31.93 
 
 
147 aa  54.7  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  33.9 
 
 
1390 aa  54.3  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1833  blue (type 1) copper domain protein  32.14 
 
 
241 aa  49.7  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.749286  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3112  blue (type1) copper domain-containing protein  30 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2366  blue (type1) copper domain-containing protein  29.09 
 
 
159 aa  48.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0881653  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.94 
 
 
1180 aa  40.8  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>