52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0658 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0658  azurin  100 
 
 		 149 aa  305  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000453216 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0546  azurin precursor  63.95 
 
 		 148 aa  201  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.148254  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0591  blue (type1) copper domain-containing protein  62.59 
 
 		 148 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0210  blue (type1) copper domain-containing protein  58.78 
 
 		 149 aa  187  5e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0250042  normal  0.405619 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4923  azurin  63.7 
 
 		 136 aa  186  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4226  azurin  64.34 
 
 		 152 aa  186  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.151542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65000  azurin precursor  65.99 
 
 		 148 aa  186  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5648  azurin precursor  65.31 
 
 		 148 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2435  azurin  62.79 
 
 		 155 aa  180  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.557296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0658  azurin  55.03 
 
 		 158 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.998691  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3772  azurin  55.03 
 
 		 158 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3649  azurin  55.03 
 
 		 158 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127621  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3581  azurin  55.03 
 
 		 158 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4926  azurin  56.76 
 
 		 150 aa  176  8e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000893264 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4748  azurin  56.08 
 
 		 150 aa  174  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4870  azurin  56.08 
 
 		 149 aa  174  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4662  azurin  56.08 
 
 		 150 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0388565 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0938  blue (type1) copper domain-containing protein  58.73 
 
 		 157 aa  169  9e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000352291  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3180  azurin  55.63 
 
 		 158 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01601  azurin precursor  57.36 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21134  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3478  blue (type1) copper domain-containing protein  55.7 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1535  azurin  62.7 
 
 		 153 aa  161  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0645  blue (type1) copper domain-containing protein  54.36 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.478569 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3308  blue (type1) copper domain-containing protein  54.36 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3740  azurin  47.71 
 
 		 162 aa  159  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0809  azurin precursor  54.67 
 
 		 158 aa  157  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001298  azurin  47.55 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0556  blue (type1) copper domain-containing protein  47.65 
 
 		 199 aa  152  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.73332 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4088  azurin  61.24 
 
 		 149 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0681809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05169  azurin  45.45 
 
 		 150 aa  147  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1745  electron transfer protein azurin I  46.26 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02282  azurin  47.86 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1672  azurin  46.26 
 
 		 151 aa  142  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3289  azurin  48.84 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.949678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2909  azurin  39.2 
 
 		 165 aa  90.1  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2412  blue (type1) copper domain-containing protein  37.76 
 
 		 173 aa  88.6  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  39.85 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1802  blue (type1) copper domain-containing protein  36.11 
 
 		 179 aa  77  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0327  blue (type 1) copper domain protein  36.13 
 
 		 164 aa  70.1  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0741181 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  38.64 
 
 		 287 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1209  blue (type 1) copper domain protein  27.97 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.61 
 
 		 1306 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3112  blue (type1) copper domain-containing protein  35.24 
 
 		 159 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  32.18 
 
 		 669 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2366  blue (type1) copper domain-containing protein  33.03 
 
 		 159 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0881653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4905  blue (type1) copper domain-containing protein  37.21 
 
 		 160 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0465792  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.87 
 
 		 1265 aa  42.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1100  blue (type 1) copper domain protein  28.74 
 
 		 673 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303689  normal  0.203492 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.14 
 
 		 1180 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  34.12 
 
 		 1390 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.34 
 
 		 1274 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1172  blue (type 1) copper domain protein  27.2 
 
 		 358 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>