53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4923 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4923  azurin  100 
 
 		 136 aa  282  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0591  blue (type1) copper domain-containing protein  87.5 
 
 		 148 aa  259  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0546  azurin precursor  72.06 
 
 		 148 aa  206  8e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.148254  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5648  azurin precursor  66.93 
 
 		 148 aa  193  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65000  azurin precursor  66.14 
 
 		 148 aa  193  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4870  azurin  65.69 
 
 		 149 aa  191  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4748  azurin  65.69 
 
 		 150 aa  191  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4662  azurin  65.69 
 
 		 150 aa  189  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0388565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4926  azurin  63.5 
 
 		 150 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000893264 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0658  azurin  63.91 
 
 		 149 aa  183  6e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000453216 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0210  blue (type1) copper domain-containing protein  58.82 
 
 		 149 aa  173  9e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0250042  normal  0.405619 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3772  azurin  55.3 
 
 		 158 aa  166  9e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3649  azurin  55.3 
 
 		 158 aa  166  9e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127621  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0658  azurin  55.3 
 
 		 158 aa  166  9e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.998691  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3581  azurin  55.3 
 
 		 158 aa  166  9e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01601  azurin precursor  54.62 
 
 		 149 aa  163  8e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21134  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2435  azurin  53.12 
 
 		 155 aa  159  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.557296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4226  azurin  50.38 
 
 		 152 aa  157  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.151542 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1535  azurin  53.97 
 
 		 153 aa  149  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3740  azurin  48.84 
 
 		 162 aa  148  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0938  blue (type1) copper domain-containing protein  49.61 
 
 		 157 aa  149  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000352291  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0809  azurin precursor  54.55 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3180  azurin  55.3 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05169  azurin  44.85 
 
 		 150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001298  azurin  44.85 
 
 		 150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3478  blue (type1) copper domain-containing protein  53.03 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3308  blue (type1) copper domain-containing protein  53.03 
 
 		 158 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0645  blue (type1) copper domain-containing protein  53.03 
 
 		 158 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.478569 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4088  azurin  53.91 
 
 		 149 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0681809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0556  blue (type1) copper domain-containing protein  46.09 
 
 		 199 aa  135  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.73332 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02282  azurin  46.09 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1745  electron transfer protein azurin I  43.61 
 
 		 151 aa  128  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3289  azurin  43.2 
 
 		 149 aa  127  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.949678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1672  azurin  42.86 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2909  azurin  37.5 
 
 		 165 aa  87.4  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2412  blue (type1) copper domain-containing protein  33.59 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  34.68 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1802  blue (type1) copper domain-containing protein  34.53 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1209  blue (type 1) copper domain protein  35.29 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0327  blue (type 1) copper domain protein  35.63 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0741181 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  28.57 
 
 		 287 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1100  blue (type 1) copper domain protein  28.57 
 
 		 673 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303689  normal  0.203492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  32.58 
 
 		 669 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.97 
 
 		 1390 aa  50.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1833  blue (type 1) copper domain protein  36.47 
 
 		 241 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.749286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4905  blue (type1) copper domain-containing protein  35.29 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0465792  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2366  blue (type1) copper domain-containing protein  31.5 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0881653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.51 
 
 		 1306 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1172  blue (type 1) copper domain protein  28.69 
 
 		 358 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3112  blue (type1) copper domain-containing protein  29.92 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  34.41 
 
 		 1265 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1880  blue (type 1) copper domain protein  28.74 
 
 		 722 aa  45.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.459048 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  31.87 
 
 		 1274 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>