54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4226 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4226  azurin  100 
 
 
152 aa  310  5.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.151542 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2435  azurin  78.46 
 
 
155 aa  219  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.557296  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1535  azurin  72.66 
 
 
153 aa  187  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0658  azurin  64.93 
 
 
149 aa  185  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000453216 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65000  azurin precursor  64.29 
 
 
148 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5648  azurin precursor  63.49 
 
 
148 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0210  blue (type1) copper domain-containing protein  56.08 
 
 
149 aa  179  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0250042  normal  0.405619 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3740  azurin  54.29 
 
 
162 aa  169  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0546  azurin precursor  53.52 
 
 
148 aa  167  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.148254  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01601  azurin precursor  51.72 
 
 
149 aa  166  8e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21134  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0591  blue (type1) copper domain-containing protein  51.75 
 
 
148 aa  165  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0938  blue (type1) copper domain-containing protein  57.94 
 
 
157 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000352291  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3581  azurin  57.03 
 
 
158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0658  azurin  57.03 
 
 
158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.998691  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3772  azurin  57.03 
 
 
158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3649  azurin  57.03 
 
 
158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127621  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001298  azurin  58.06 
 
 
150 aa  161  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4088  azurin  62.79 
 
 
149 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0681809  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4923  azurin  50.38 
 
 
136 aa  157  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0809  azurin precursor  55.24 
 
 
158 aa  152  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3478  blue (type1) copper domain-containing protein  55.63 
 
 
158 aa  152  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3180  azurin  54.93 
 
 
158 aa  150  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0645  blue (type1) copper domain-containing protein  54.93 
 
 
158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.478569 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3308  blue (type1) copper domain-containing protein  54.93 
 
 
158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02282  azurin  51.41 
 
 
149 aa  149  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05169  azurin  53.66 
 
 
150 aa  148  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4748  azurin  48.59 
 
 
150 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4870  azurin  48.59 
 
 
149 aa  147  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00722252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4926  azurin  48.59 
 
 
150 aa  146  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000893264 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4662  azurin  46.58 
 
 
150 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0388565 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1745  electron transfer protein azurin I  49.64 
 
 
151 aa  144  5e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3289  azurin  47.3 
 
 
149 aa  142  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.949678  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1672  azurin  45.95 
 
 
151 aa  142  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0556  blue (type1) copper domain-containing protein  46.15 
 
 
199 aa  143  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.73332 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2412  blue (type1) copper domain-containing protein  45.59 
 
 
173 aa  104  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2909  azurin  47.2 
 
 
165 aa  97.1  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1802  blue (type1) copper domain-containing protein  39.57 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  36.8 
 
 
161 aa  80.5  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  42.86 
 
 
287 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1209  blue (type 1) copper domain protein  41.18 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0327  blue (type 1) copper domain protein  31.09 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0741181 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4905  blue (type1) copper domain-containing protein  36.63 
 
 
160 aa  53.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0465792  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2366  blue (type1) copper domain-containing protein  31.06 
 
 
159 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0881653  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1172  blue (type 1) copper domain protein  27.56 
 
 
358 aa  50.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3112  blue (type1) copper domain-containing protein  31.06 
 
 
159 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1833  blue (type 1) copper domain protein  35.25 
 
 
241 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.749286  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  32.58 
 
 
669 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  40 
 
 
1390 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  31.67 
 
 
1306 aa  44.7  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.65 
 
 
1265 aa  44.3  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0335  blue (type 1) copper domain protein  30.77 
 
 
373 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1100  blue (type 1) copper domain protein  29.21 
 
 
673 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303689  normal  0.203492 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.34 
 
 
1180 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1880  blue (type 1) copper domain protein  34.92 
 
 
722 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.459048 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>