50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4748 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4748  azurin  100 
 
 		 150 aa  306  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4870  azurin  100 
 
 		 149 aa  304  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4662  azurin  95.33 
 
 		 150 aa  294  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0388565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4926  azurin  94 
 
 		 150 aa  290  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000893264 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0591  blue (type1) copper domain-containing protein  66.44 
 
 		 148 aa  209  9e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0546  azurin precursor  65.1 
 
 		 148 aa  201  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.148254  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4923  azurin  65.69 
 
 		 136 aa  191  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5648  azurin precursor  60.16 
 
 		 148 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65000  azurin precursor  59.38 
 
 		 148 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0658  azurin  57.46 
 
 		 149 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000453216 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0210  blue (type1) copper domain-containing protein  52 
 
 		 149 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0250042  normal  0.405619 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4226  azurin  48.59 
 
 		 152 aa  147  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.151542 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001298  azurin  42.76 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0658  azurin  47.22 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.998691  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3772  azurin  47.22 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3581  azurin  47.22 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3649  azurin  47.22 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127621  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3289  azurin  46.15 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.949678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05169  azurin  42.55 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01601  azurin precursor  43.62 
 
 		 149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21134  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2435  azurin  46.21 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.557296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0938  blue (type1) copper domain-containing protein  48.44 
 
 		 157 aa  135  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000352291  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1535  azurin  52.03 
 
 		 153 aa  131  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3740  azurin  42.96 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02282  azurin  42.18 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3180  azurin  45.89 
 
 		 158 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0645  blue (type1) copper domain-containing protein  44.37 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.478569 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3308  blue (type1) copper domain-containing protein  44.37 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3478  blue (type1) copper domain-containing protein  43.33 
 
 		 158 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4088  azurin  46.51 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0681809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1745  electron transfer protein azurin I  36.3 
 
 		 151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0809  azurin precursor  43.33 
 
 		 158 aa  116  9e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1672  azurin  36.3 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0556  blue (type1) copper domain-containing protein  38.1 
 
 		 199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.73332 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2412  blue (type1) copper domain-containing protein  35.04 
 
 		 173 aa  85.9  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  35.71 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2909  azurin  36.22 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1802  blue (type1) copper domain-containing protein  34.06 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1209  blue (type 1) copper domain protein  33.05 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1100  blue (type 1) copper domain protein  31.5 
 
 		 673 aa  57.4  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303689  normal  0.203492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.77 
 
 		 1265 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0327  blue (type 1) copper domain protein  33.88 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0741181 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 287 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3112  blue (type1) copper domain-containing protein  35 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2366  blue (type1) copper domain-containing protein  36.59 
 
 		 159 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0881653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.41 
 
 		 1390 aa  49.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  26.56 
 
 		 669 aa  47  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4905  blue (type1) copper domain-containing protein  38.46 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0465792  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.34 
 
 		 1171 aa  44.7  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1172  blue (type 1) copper domain protein  26.95 
 
 		 358 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>