47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4088 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4088  azurin  100 
 
 		 149 aa  308  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0681809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65000  azurin precursor  64 
 
 		 148 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5648  azurin precursor  63.2 
 
 		 148 aa  179  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4226  azurin  60.42 
 
 		 152 aa  178  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.151542 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0591  blue (type1) copper domain-containing protein  51.7 
 
 		 148 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0658  azurin  61.72 
 
 		 149 aa  167  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000453216 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2435  azurin  57.81 
 
 		 155 aa  167  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.557296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0546  azurin precursor  51.7 
 
 		 148 aa  165  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.148254  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0210  blue (type1) copper domain-containing protein  50.35 
 
 		 149 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0250042  normal  0.405619 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4923  azurin  53.91 
 
 		 136 aa  157  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1535  azurin  56.8 
 
 		 153 aa  146  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1745  electron transfer protein azurin I  51.08 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3649  azurin  49.31 
 
 		 158 aa  144  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3772  azurin  49.31 
 
 		 158 aa  144  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0658  azurin  49.31 
 
 		 158 aa  144  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.998691  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02282  azurin  48.61 
 
 		 149 aa  145  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3581  azurin  49.31 
 
 		 158 aa  144  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4870  azurin  43.92 
 
 		 149 aa  141  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4748  azurin  43.92 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01601  azurin precursor  44.3 
 
 		 149 aa  141  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21134  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4926  azurin  43.92 
 
 		 150 aa  141  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000893264 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0938  blue (type1) copper domain-containing protein  48.61 
 
 		 157 aa  140  5e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000352291  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1672  azurin  50.36 
 
 		 151 aa  140  6e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0556  blue (type1) copper domain-containing protein  44.83 
 
 		 199 aa  138  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.73332 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4662  azurin  43.24 
 
 		 150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0388565 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001298  azurin  43.62 
 
 		 150 aa  136  8.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3740  azurin  45.45 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3180  azurin  50.35 
 
 		 158 aa  134  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3478  blue (type1) copper domain-containing protein  50 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0645  blue (type1) copper domain-containing protein  50.35 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.478569 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3308  blue (type1) copper domain-containing protein  50.35 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0809  azurin precursor  50.35 
 
 		 158 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3289  azurin  44.68 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.949678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05169  azurin  42.14 
 
 		 150 aa  124  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2412  blue (type1) copper domain-containing protein  38.13 
 
 		 173 aa  89.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2909  azurin  38.4 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  35.51 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1802  blue (type1) copper domain-containing protein  36.24 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0327  blue (type 1) copper domain protein  34.11 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0741181 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  40.4 
 
 		 287 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4905  blue (type1) copper domain-containing protein  34.34 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0465792  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  33.33 
 
 		 1306 aa  52.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1209  blue (type 1) copper domain protein  37.21 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1172  blue (type 1) copper domain protein  28.57 
 
 		 358 aa  50.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  30.66 
 
 		 669 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.51 
 
 		 1265 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1100  blue (type 1) copper domain protein  27.01 
 
 		 673 aa  41.6  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303689  normal  0.203492 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>