53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0591 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_0591  blue (type1) copper domain-containing protein  100 
 
 
148 aa  305  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4923  azurin  87.5 
 
 
136 aa  259  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0546  azurin precursor  72.97 
 
 
148 aa  227  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.148254  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4748  azurin  66.44 
 
 
150 aa  209  9e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4870  azurin  66.44 
 
 
149 aa  209  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00722252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4662  azurin  66.44 
 
 
150 aa  207  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0388565 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65000  azurin precursor  71.62 
 
 
148 aa  207  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5648  azurin precursor  71.62 
 
 
148 aa  207  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4926  azurin  64.43 
 
 
150 aa  203  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000893264 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0658  azurin  62.59 
 
 
149 aa  187  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000453216 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0210  blue (type1) copper domain-containing protein  59.31 
 
 
149 aa  185  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0250042  normal  0.405619 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01601  azurin precursor  51.35 
 
 
149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21134  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4226  azurin  51.75 
 
 
152 aa  165  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.151542 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3581  azurin  48.67 
 
 
158 aa  164  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0658  azurin  48.67 
 
 
158 aa  164  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.998691  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3772  azurin  48.67 
 
 
158 aa  164  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3649  azurin  48.67 
 
 
158 aa  164  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127621  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2435  azurin  53.12 
 
 
155 aa  159  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.557296  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1535  azurin  59.52 
 
 
153 aa  154  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0809  azurin precursor  49.67 
 
 
158 aa  150  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001298  azurin  45.27 
 
 
150 aa  150  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0938  blue (type1) copper domain-containing protein  51.97 
 
 
157 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000352291  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3180  azurin  49.33 
 
 
158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05169  azurin  44 
 
 
150 aa  147  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3478  blue (type1) copper domain-containing protein  48 
 
 
158 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3740  azurin  46.51 
 
 
162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0645  blue (type1) copper domain-containing protein  47.33 
 
 
158 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.478569 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3308  blue (type1) copper domain-containing protein  47.33 
 
 
158 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4088  azurin  54.69 
 
 
149 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0681809  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0556  blue (type1) copper domain-containing protein  43.54 
 
 
199 aa  142  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.73332 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02282  azurin  45.77 
 
 
149 aa  140  8e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1745  electron transfer protein azurin I  42.18 
 
 
151 aa  136  7.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1672  azurin  42.18 
 
 
151 aa  134  4e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3289  azurin  43.57 
 
 
149 aa  128  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.949678  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2909  azurin  37.4 
 
 
165 aa  85.9  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2412  blue (type1) copper domain-containing protein  30.77 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  36.22 
 
 
161 aa  80.5  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1802  blue (type1) copper domain-containing protein  35 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  31.67 
 
 
287 aa  61.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4905  blue (type1) copper domain-containing protein  40.2 
 
 
160 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0465792  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0327  blue (type 1) copper domain protein  38.55 
 
 
164 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0741181 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1209  blue (type 1) copper domain protein  39.53 
 
 
147 aa  57  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1172  blue (type 1) copper domain protein  28.38 
 
 
358 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1100  blue (type 1) copper domain protein  26.4 
 
 
673 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303689  normal  0.203492 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.86 
 
 
1390 aa  48.5  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1833  blue (type 1) copper domain protein  34.78 
 
 
241 aa  48.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.749286  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.87 
 
 
1306 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2366  blue (type1) copper domain-containing protein  33.86 
 
 
159 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0881653  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3112  blue (type1) copper domain-containing protein  32.28 
 
 
159 aa  47  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.22 
 
 
1274 aa  46.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.89 
 
 
1265 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  25.98 
 
 
669 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.77 
 
 
1180 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>