53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0645 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0645  blue (type1) copper domain-containing protein  100 
 
 		 158 aa  322  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.478569 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3308  blue (type1) copper domain-containing protein  100 
 
 		 158 aa  322  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3772  azurin  89.81 
 
 		 158 aa  293  5e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3581  azurin  89.81 
 
 		 158 aa  293  5e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3649  azurin  89.81 
 
 		 158 aa  293  5e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127621  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0658  azurin  89.81 
 
 		 158 aa  293  5e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.998691  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3478  blue (type1) copper domain-containing protein  97.47 
 
 		 158 aa  291  3e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0809  azurin precursor  93.04 
 
 		 158 aa  277  5e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3180  azurin  87.26 
 
 		 158 aa  264  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0938  blue (type1) copper domain-containing protein  82.81 
 
 		 157 aa  233  6e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000352291  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3740  azurin  64.6 
 
 		 162 aa  215  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001298  azurin  60.43 
 
 		 150 aa  177  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05169  azurin  57.82 
 
 		 150 aa  175  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01601  azurin precursor  56.93 
 
 		 149 aa  173  8e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21134  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0658  azurin  58.59 
 
 		 149 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000453216 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4226  azurin  54.93 
 
 		 152 aa  165  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.151542 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2435  azurin  56.15 
 
 		 155 aa  163  9e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.557296  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4923  azurin  53.03 
 
 		 136 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0591  blue (type1) copper domain-containing protein  47.33 
 
 		 148 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0210  blue (type1) copper domain-containing protein  50.35 
 
 		 149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0250042  normal  0.405619 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65000  azurin precursor  49.61 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0546  azurin precursor  45.33 
 
 		 148 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.148254  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5648  azurin precursor  48.82 
 
 		 148 aa  151  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1745  electron transfer protein azurin I  51.54 
 
 		 151 aa  144  3e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1672  azurin  46.36 
 
 		 151 aa  144  7.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1535  azurin  56.35 
 
 		 153 aa  143  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3289  azurin  50.36 
 
 		 149 aa  143  8.000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.949678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4662  azurin  45.03 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0388565 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4870  azurin  44.37 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4748  azurin  44.37 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0556  blue (type1) copper domain-containing protein  42.47 
 
 		 199 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.73332 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4926  azurin  43.71 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000893264 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02282  azurin  46.62 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4088  azurin  51.94 
 
 		 149 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0681809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2909  azurin  41.67 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2412  blue (type1) copper domain-containing protein  40.15 
 
 		 173 aa  95.9  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  36.22 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1802  blue (type1) copper domain-containing protein  32.54 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0327  blue (type 1) copper domain protein  35.83 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0741181 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  34.43 
 
 		 1265 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  30.71 
 
 		 287 aa  61.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  35.11 
 
 		 1306 aa  61.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  30 
 
 		 669 aa  60.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1100  blue (type 1) copper domain protein  28.93 
 
 		 673 aa  58.9  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303689  normal  0.203492 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1209  blue (type 1) copper domain protein  29.41 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1172  blue (type 1) copper domain protein  31.39 
 
 		 358 aa  54.3  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3112  blue (type1) copper domain-containing protein  30.91 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2366  blue (type1) copper domain-containing protein  30.63 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0881653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  31.03 
 
 		 1390 aa  50.8  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1833  blue (type 1) copper domain protein  32.14 
 
 		 241 aa  50.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.749286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.89 
 
 		 1180 aa  48.5  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.4 
 
 		 1274 aa  47  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.75 
 
 		 1171 aa  40.4  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>