55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3740 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_3740  azurin  100 
 
 
162 aa  332  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3649  azurin  67.28 
 
 
158 aa  225  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127621  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3581  azurin  67.28 
 
 
158 aa  225  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3772  azurin  67.28 
 
 
158 aa  225  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0658  azurin  67.28 
 
 
158 aa  225  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.998691  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3478  blue (type1) copper domain-containing protein  66.46 
 
 
158 aa  202  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3180  azurin  66.46 
 
 
158 aa  200  6e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0809  azurin precursor  65.84 
 
 
158 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3308  blue (type1) copper domain-containing protein  64.6 
 
 
158 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0645  blue (type1) copper domain-containing protein  64.6 
 
 
158 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.478569 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0938  blue (type1) copper domain-containing protein  69.53 
 
 
157 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000352291  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05169  azurin  62.41 
 
 
150 aa  182  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001298  azurin  60.99 
 
 
150 aa  181  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2435  azurin  57.25 
 
 
155 aa  169  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.557296  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4226  azurin  54.29 
 
 
152 aa  169  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.151542 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01601  azurin precursor  53.62 
 
 
149 aa  164  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21134  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0658  azurin  53.12 
 
 
149 aa  158  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000453216 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1745  electron transfer protein azurin I  55.3 
 
 
151 aa  152  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1672  azurin  54.55 
 
 
151 aa  149  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3289  azurin  48.92 
 
 
149 aa  148  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.949678  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4923  azurin  48.84 
 
 
136 aa  148  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0210  blue (type1) copper domain-containing protein  46.1 
 
 
149 aa  147  8e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0250042  normal  0.405619 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0591  blue (type1) copper domain-containing protein  46.51 
 
 
148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02282  azurin  49.64 
 
 
149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65000  azurin precursor  47.24 
 
 
148 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0546  azurin precursor  44.22 
 
 
148 aa  143  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.148254  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5648  azurin precursor  46.46 
 
 
148 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1535  azurin  55.74 
 
 
153 aa  138  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4662  azurin  42.96 
 
 
150 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0388565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4926  azurin  42.96 
 
 
150 aa  131  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000893264 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4748  azurin  42.96 
 
 
150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4870  azurin  42.96 
 
 
149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00722252 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0556  blue (type1) copper domain-containing protein  43.8 
 
 
199 aa  125  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.73332 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4088  azurin  44.96 
 
 
149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0681809  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2909  azurin  41.45 
 
 
165 aa  103  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2412  blue (type1) copper domain-containing protein  43.28 
 
 
173 aa  99.8  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  30.88 
 
 
161 aa  77.8  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1802  blue (type1) copper domain-containing protein  35.25 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0327  blue (type 1) copper domain protein  30.33 
 
 
164 aa  61.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0741181 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  33.86 
 
 
1306 aa  60.5  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1209  blue (type 1) copper domain protein  28.57 
 
 
147 aa  58.5  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  30.53 
 
 
669 aa  54.3  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  32.48 
 
 
287 aa  51.2  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  31.45 
 
 
1265 aa  50.8  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1100  blue (type 1) copper domain protein  29.03 
 
 
673 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303689  normal  0.203492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1172  blue (type 1) copper domain protein  30.56 
 
 
358 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2366  blue (type1) copper domain-containing protein  30.43 
 
 
159 aa  47.4  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0881653  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4905  blue (type1) copper domain-containing protein  30.39 
 
 
160 aa  47.4  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0465792  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3112  blue (type1) copper domain-containing protein  30.43 
 
 
159 aa  47.4  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.68 
 
 
1180 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.51 
 
 
1390 aa  43.9  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1833  blue (type 1) copper domain protein  32.06 
 
 
241 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.749286  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0335  blue (type 1) copper domain protein  24.5 
 
 
373 aa  42.4  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.12 
 
 
1171 aa  41.6  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.17 
 
 
1274 aa  40.8  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>