159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1437 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  43.63 
 
 		 1503 aa  668    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  50.53 
 
 		 1265 aa  837    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 1171 aa  2433    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  50.35 
 
 		 1274 aa  853    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  53.07 
 
 		 1180 aa  1276    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0332  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.63 
 
 		 705 aa  240  9e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0666  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.39 
 
 		 1181 aa  213  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4779  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.14 
 
 		 1162 aa  207  6e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0358  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.51 
 
 		 712 aa  196  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.11 
 
 		 1306 aa  194  6e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1564  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.93 
 
 		 1193 aa  194  8e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1373  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.46 
 
 		 1149 aa  192  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4998  cytochrome c class I  29.46 
 
 		 756 aa  184  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0614505  normal  0.826099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4716  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.01 
 
 		 759 aa  180  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0863725  normal  0.0139154 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3985  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.29 
 
 		 852 aa  172  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188405  normal  0.0691409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1262  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.14 
 
 		 1068 aa  166  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5354  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.45 
 
 		 951 aa  162  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0902  heme-binding protein  30.05 
 
 		 1139 aa  162  5e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2449  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.82 
 
 		 762 aa  161  7e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.896022 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4984  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.92 
 
 		 1055 aa  159  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5000  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.92 
 
 		 749 aa  157  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.652472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6338  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.28 
 
 		 957 aa  155  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0279  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.61 
 
 		 1286 aa  154  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.624688  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2734  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.84 
 
 		 1084 aa  147  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.552836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3055  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.97 
 
 		 868 aa  142  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0403  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.39 
 
 		 773 aa  140  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5811  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.65 
 
 		 1040 aa  133  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3060  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.11 
 
 		 1027 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.329582  normal  0.577758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3707  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.8 
 
 		 968 aa  125  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.36 
 
 		 1390 aa  125  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5487  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.61 
 
 		 1023 aa  107  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.181879 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0029  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.87 
 
 		 1201 aa  105  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167421  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0335  blue (type 1) copper domain protein  47.5 
 
 		 373 aa  100  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  34.95 
 
 		 219 aa  99.8  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1880  blue (type 1) copper domain protein  43.24 
 
 		 722 aa  99.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.459048 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1100  blue (type 1) copper domain protein  41.18 
 
 		 673 aa  99  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303689  normal  0.203492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  43.24 
 
 		 669 aa  97.8  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  25.59 
 
 		 1439 aa  91.3  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1972  heme-binding protein  25.29 
 
 		 1110 aa  91.3  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1382  glycosyl hydrolase  30.04 
 
 		 296 aa  87  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213541  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2820  hypothetical protein  28.99 
 
 		 306 aa  87  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  hitchhiker  0.00217899 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0811  hypothetical protein  28.49 
 
 		 245 aa  80.5  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.8275 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  28.35 
 
 		 1444 aa  79.3  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1209  blue (type 1) copper domain protein  37.01 
 
 		 147 aa  79  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  28.16 
 
 		 1135 aa  77.8  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6210  heme-binding protein  26.65 
 
 		 1141 aa  76.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7276  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 272 aa  75.5  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  26.07 
 
 		 1142 aa  75.1  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.16 
 
 		 478 aa  74.7  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  26.76 
 
 		 285 aa  73.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  28.2 
 
 		 279 aa  72.8  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  28.14 
 
 		 1151 aa  72.8  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1518  hypothetical protein  31.64 
 
 		 220 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6311  hypothetical protein  31.64 
 
 		 220 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.566642 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6969  hypothetical protein  31.64 
 
 		 220 aa  71.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  26.63 
 
 		 1143 aa  71.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3112  blue (type1) copper domain-containing protein  36.29 
 
 		 159 aa  70.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4406  hypothetical protein  28.28 
 
 		 217 aa  70.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192664  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1220  sigma-70 factor  28.51 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0178676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0831  secreted glycosyl hydrolase  27.44 
 
 		 223 aa  67.8  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1906  hypothetical protein  29.79 
 
 		 233 aa  67.8  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1436  heme-binding protein  24.06 
 
 		 1058 aa  68.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1802  blue (type1) copper domain-containing protein  32.89 
 
 		 179 aa  67.8  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4620  heme-binding protein  24.4 
 
 		 1143 aa  68.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 232 aa  67.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2366  blue (type1) copper domain-containing protein  34.68 
 
 		 159 aa  67  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0881653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  31.58 
 
 		 161 aa  67.4  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 800 aa  65.5  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4699  hypothetical protein  28.24 
 
 		 243 aa  65.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.474373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  25.27 
 
 		 460 aa  64.3  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2465  heme-binding protein  22.22 
 
 		 1137 aa  64.3  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1172  blue (type 1) copper domain protein  35.78 
 
 		 358 aa  63.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1803  hypothetical protein  23.23 
 
 		 292 aa  63.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  26.18 
 
 		 1194 aa  63.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  22.71 
 
 		 1138 aa  63.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  28.28 
 
 		 375 aa  63.2  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  22.88 
 
 		 436 aa  62.4  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3453  hypothetical protein  27.32 
 
 		 217 aa  62  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  24.9 
 
 		 1200 aa  62.4  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  28.27 
 
 		 247 aa  62  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0327  blue (type 1) copper domain protein  35.2 
 
 		 164 aa  61.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0741181 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  26.6 
 
 		 275 aa  60.1  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  24.5 
 
 		 381 aa  59.7  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02570  glycosyl-hydrolase, putative  24.76 
 
 		 346 aa  59.3  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  29.51 
 
 		 1505 aa  59.3  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3256  hypothetical protein  27.57 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1804  hypothetical protein  28.23 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1600  hypothetical protein  29.07 
 
 		 227 aa  58.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988724  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3539  hypothetical protein  28.57 
 
 		 514 aa  58.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.294562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  22.86 
 
 		 371 aa  56.2  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0941  L-sorbosone dehydrogenase, putative  21.55 
 
 		 361 aa  56.2  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0785845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0382  hypothetical protein  24.31 
 
 		 245 aa  55.8  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3989  hypothetical protein  27.56 
 
 		 214 aa  55.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4526  sigma-70 factor  29.38 
 
 		 255 aa  55.5  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2634  blue (type 1) copper domain protein  27.87 
 
 		 140 aa  55.5  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0120  hypothetical protein  28.95 
 
 		 221 aa  55.5  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2909  azurin  32.77 
 
 		 165 aa  55.5  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0731  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 245 aa  55.5  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  23.33 
 
 		 1182 aa  55.5  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3122  L-sorbosone dehydrogenase  22.37 
 
 		 418 aa  55.1  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>