76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1209 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1209  blue (type 1) copper domain protein  100 
 
 		 147 aa  298  1e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  40.82 
 
 		 1274 aa  103  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0327  blue (type 1) copper domain protein  48.25 
 
 		 164 aa  94  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0741181 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1100  blue (type 1) copper domain protein  38.94 
 
 		 673 aa  88.6  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303689  normal  0.203492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  35.07 
 
 		 1265 aa  85.5  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  37.17 
 
 		 669 aa  84  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  34.13 
 
 		 1306 aa  82.4  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2366  blue (type1) copper domain-containing protein  41.32 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0881653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  34.96 
 
 		 1390 aa  81.3  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  33.58 
 
 		 1171 aa  80.5  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3112  blue (type1) copper domain-containing protein  39.67 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001298  azurin  33.58 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1880  blue (type 1) copper domain protein  37.17 
 
 		 722 aa  78.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.459048 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05169  azurin  33.58 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  34.19 
 
 		 161 aa  77  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2909  azurin  31.85 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1802  blue (type1) copper domain-containing protein  38.14 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0335  blue (type 1) copper domain protein  34.69 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2412  blue (type1) copper domain-containing protein  33.58 
 
 		 173 aa  70.9  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  35.19 
 
 		 1180 aa  70.5  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1745  electron transfer protein azurin I  34.45 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1672  azurin  33.33 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3289  azurin  34.29 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.949678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1172  blue (type 1) copper domain protein  31.94 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  37.61 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02282  azurin  28.57 
 
 		 149 aa  62  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1833  blue (type 1) copper domain protein  32.31 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.749286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4226  azurin  34.27 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.151542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4748  azurin  33.05 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4870  azurin  33.05 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722252 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0591  blue (type1) copper domain-containing protein  32.24 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3740  azurin  27.89 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4923  azurin  35.29 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2634  blue (type 1) copper domain protein  26.9 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5648  azurin precursor  38.82 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4662  azurin  32.2 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0388565 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3478  blue (type1) copper domain-containing protein  29.61 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3772  azurin  30.5 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0658  azurin  30.5 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.998691  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3649  azurin  30.5 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127621  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3581  azurin  30.5 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4926  azurin  31.36 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000893264 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65000  azurin precursor  36.47 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0645  blue (type1) copper domain-containing protein  28.95 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.478569 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3308  blue (type1) copper domain-containing protein  28.95 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3180  azurin  26.76 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01601  azurin precursor  26.57 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21134  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2435  azurin  36.05 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.557296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0522  blue (type 1) copper domain protein  34.81 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0809  azurin precursor  29.73 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4088  azurin  37.21 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0681809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0658  azurin  27.97 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000453216 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0210  blue (type1) copper domain-containing protein  32.14 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0250042  normal  0.405619 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0556  blue (type1) copper domain-containing protein  28.87 
 
 		 199 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.73332 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0938  blue (type1) copper domain-containing protein  27.35 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000352291  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1207  blue (type 1) copper domain protein  28.8 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1535  azurin  33.03 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0546  azurin precursor  31.82 
 
 		 148 aa  47  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.148254  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2350  hypothetical protein  25.61 
 
 		 182 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0960  plastocyanin  34.55 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.821855  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2601  blue (type1) copper domain-containing protein  30.63 
 
 		 160 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377321  normal  0.709674 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0734  blue (type 1) copper domain protein  30.97 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  33.61 
 
 		 505 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4905  blue (type1) copper domain-containing protein  30.11 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0465792  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2921  blue (type 1) copper domain protein  29.51 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0439603  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3995  blue (type1) copper domain-containing protein  29.17 
 
 		 180 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.704782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34733  plastocyanin, chloroplast precursor  33.33 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1667  blue (type1) copper domain-containing protein  28.18 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2721  blue (type1) copper domain-containing protein  28.91 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0479159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4551  blue (type1) copper domain-containing protein  28.57 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3263  putative copper binding protein  28.12 
 
 		 176 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  31.48 
 
 		 875 aa  40.8  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1635  oxidoreductase  29.2 
 
 		 181 aa  40.8  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.400621  normal  0.0387336 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0348  blue (type1) copper domain-containing protein  26.23 
 
 		 189 aa  40.4  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471869 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5106  blue (type 1) copper domain protein  29.25 
 
 		 160 aa  40.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549955 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1833  blue (type 1) copper domain protein  28 
 
 		 159 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584393 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>