64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0348 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0348  blue (type1) copper domain-containing protein  100 
 
 		 189 aa  385  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471869 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1676  blue (type1) copper domain-containing protein  36.65 
 
 		 167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3854  uncharacterized copper-binding protein  40.79 
 
 		 177 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1700  blue (type1) copper domain-containing protein  39.87 
 
 		 175 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435665 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2159  plastocyanin/azurin family copper binding protein  35.63 
 
 		 175 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0076427  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3583  hypothetical protein  35.63 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27840  hypothetical protein  37.18 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2350  hypothetical protein  36.13 
 
 		 182 aa  101  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2721  blue (type1) copper domain-containing protein  38.97 
 
 		 166 aa  98.6  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0479159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2197  blue (type 1) copper domain protein  40.44 
 
 		 164 aa  98.2  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5685  blue (type 1) copper domain protein  41.79 
 
 		 168 aa  96.3  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0125  copper-binding protein  35.46 
 
 		 177 aa  93.2  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3913  blue (type 1) copper domain protein  40 
 
 		 162 aa  92  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4027  blue (type 1) copper domain protein  40 
 
 		 162 aa  92  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0457304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  35.8 
 
 		 272 aa  91.7  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0575  blue (type1) copper domain-containing protein  36.69 
 
 		 154 aa  91.3  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0159129  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2668  blue (type1) copper domain-containing protein  40.3 
 
 		 163 aa  91.3  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  0.234604 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0969  hypothetical protein  37.17 
 
 		 169 aa  91.3  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2232  hypothetical protein  34.18 
 
 		 185 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.53865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4551  blue (type1) copper domain-containing protein  38.64 
 
 		 171 aa  87.8  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06367  hypothetical protein  38.89 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3263  putative copper binding protein  41.53 
 
 		 176 aa  85.9  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2231  blue (type1) copper domain-containing protein  34.69 
 
 		 177 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3995  blue (type1) copper domain-containing protein  39.42 
 
 		 180 aa  85.5  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.704782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0713  hypothetical protein  33.67 
 
 		 190 aa  85.1  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3425  putative copper tolerance protein  35.25 
 
 		 151 aa  84  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.792125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6520  putative copper tolerance protein (cupredoxin)  35.25 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001394  hypothetical protein  34.72 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000508588  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5106  blue (type 1) copper domain protein  38.35 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549955 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7873  blue (type 1) copper domain protein  32.8 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3487  blue (type1) copper domain-containing protein  34.59 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4902  blue (type1) copper domain-containing protein  38.13 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1833  blue (type 1) copper domain protein  37.12 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584393 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1635  oxidoreductase  39.39 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.400621  normal  0.0387336 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4603  blue (type1) copper domain-containing protein  36.5 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4824  blue (type1) copper domain-containing protein  32.26 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.904248  normal  0.294152 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6116  putative oxido-reductase protein CopI  38.24 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5863  blue (type 1) copper domain protein  35.77 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1267  blue (type1) copper domain-containing protein  33.15 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034808 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5030  blue (type1) copper domain-containing protein  33.58 
 
 		 159 aa  74.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4583  normal  0.77741 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2655  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2909  blue (type1) copper domain-containing protein  32.37 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.272302  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2601  blue (type1) copper domain-containing protein  29.41 
 
 		 160 aa  72  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377321  normal  0.709674 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1207  blue (type 1) copper domain protein  29.41 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0734  blue (type 1) copper domain protein  34.06 
 
 		 159 aa  70.9  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9844  copper tolerance protein  34.31 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1667  blue (type1) copper domain-containing protein  32.59 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4269  blue (type1) copper domain-containing protein  31.85 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9849  copper tolerance protein  34.31 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3980  blue (type 1) copper domain protein  31.62 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1092  blue (type 1) copper domain protein  38.38 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4053  transposase Tn3 family protein  33.86 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  31.45 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  24.31 
 
 		 534 aa  51.2  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  30.83 
 
 		 669 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2109  hypothetical protein  20.93 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0327  blue (type 1) copper domain protein  30.95 
 
 		 164 aa  46.2  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0741181 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1660  blue (type 1) copper domain protein  22.9 
 
 		 314 aa  44.7  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  27.83 
 
 		 287 aa  44.7  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1576  hypothetical protein  29.31 
 
 		 167 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0471287  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2581  blue-copper-protein-like protein  30.43 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2921  blue (type 1) copper domain protein  25.62 
 
 		 125 aa  41.6  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0439603  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3677  hypothetical protein  27.13 
 
 		 157 aa  41.6  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2540  blue-copper-protein-like protein  23.48 
 
 		 153 aa  41.6  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00275414  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>