61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2350 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2350  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27840  hypothetical protein  91.76 
 
 		 205 aa  346  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3854  uncharacterized copper-binding protein  72.96 
 
 		 177 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2231  blue (type1) copper domain-containing protein  59.87 
 
 		 177 aa  193  9e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1676  blue (type1) copper domain-containing protein  58.94 
 
 		 167 aa  177  8e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3583  hypothetical protein  51.37 
 
 		 175 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1700  blue (type1) copper domain-containing protein  50.79 
 
 		 175 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435665 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2159  plastocyanin/azurin family copper binding protein  49.73 
 
 		 175 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0076427  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0125  copper-binding protein  46.15 
 
 		 177 aa  168  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2232  hypothetical protein  44.92 
 
 		 185 aa  161  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.53865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2197  blue (type 1) copper domain protein  38.41 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2668  blue (type1) copper domain-containing protein  37.85 
 
 		 163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  0.234604 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2721  blue (type1) copper domain-containing protein  37.75 
 
 		 166 aa  109  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0479159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1635  oxidoreductase  39.47 
 
 		 181 aa  109  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.400621  normal  0.0387336 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5685  blue (type 1) copper domain protein  40.4 
 
 		 168 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2655  blue (type1) copper domain-containing protein  37.33 
 
 		 164 aa  104  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  37.82 
 
 		 272 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4824  blue (type1) copper domain-containing protein  34.22 
 
 		 160 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.904248  normal  0.294152 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0348  blue (type1) copper domain-containing protein  36.13 
 
 		 189 aa  101  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471869 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7873  blue (type 1) copper domain protein  33.33 
 
 		 156 aa  100  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3487  blue (type1) copper domain-containing protein  35.8 
 
 		 170 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4551  blue (type1) copper domain-containing protein  33.71 
 
 		 171 aa  99.4  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6520  putative copper tolerance protein (cupredoxin)  35.48 
 
 		 153 aa  98.6  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1267  blue (type1) copper domain-containing protein  34.74 
 
 		 171 aa  98.2  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034808 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5030  blue (type1) copper domain-containing protein  33.93 
 
 		 159 aa  98.2  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4583  normal  0.77741 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0713  hypothetical protein  34.42 
 
 		 190 aa  97.1  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9844  copper tolerance protein  33.33 
 
 		 159 aa  96.7  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4603  blue (type1) copper domain-containing protein  35 
 
 		 160 aa  96.7  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3980  blue (type 1) copper domain protein  34.16 
 
 		 166 aa  95.9  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3425  putative copper tolerance protein  32.28 
 
 		 151 aa  95.9  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.792125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06367  hypothetical protein  36.6 
 
 		 188 aa  95.5  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9849  copper tolerance protein  33.89 
 
 		 159 aa  95.5  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2909  blue (type1) copper domain-containing protein  38.67 
 
 		 163 aa  94.7  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.272302  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0575  blue (type1) copper domain-containing protein  34.62 
 
 		 154 aa  94.7  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0159129  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1833  blue (type 1) copper domain protein  32.61 
 
 		 159 aa  94.7  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584393 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5106  blue (type 1) copper domain protein  33.69 
 
 		 160 aa  94.7  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549955 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4902  blue (type1) copper domain-containing protein  30.77 
 
 		 156 aa  94.4  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0734  blue (type 1) copper domain protein  36.84 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4269  blue (type1) copper domain-containing protein  33.75 
 
 		 161 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6116  putative oxido-reductase protein CopI  32.52 
 
 		 158 aa  92  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0969  hypothetical protein  34.44 
 
 		 169 aa  91.3  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4027  blue (type 1) copper domain protein  32.8 
 
 		 162 aa  89.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0457304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3913  blue (type 1) copper domain protein  32.8 
 
 		 162 aa  89.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001394  hypothetical protein  36.6 
 
 		 188 aa  89.4  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000508588  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5863  blue (type 1) copper domain protein  33.12 
 
 		 159 aa  88.6  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1667  blue (type1) copper domain-containing protein  34.39 
 
 		 164 aa  87  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4053  transposase Tn3 family protein  29.95 
 
 		 166 aa  86.3  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1092  blue (type 1) copper domain protein  30.72 
 
 		 165 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3995  blue (type1) copper domain-containing protein  31.61 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.704782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1207  blue (type 1) copper domain protein  32.47 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2601  blue (type1) copper domain-containing protein  31.82 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377321  normal  0.709674 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3263  putative copper binding protein  32.58 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  25.71 
 
 		 505 aa  49.3  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2634  blue (type 1) copper domain protein  26.62 
 
 		 140 aa  48.5  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  31.29 
 
 		 161 aa  47.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1209  blue (type 1) copper domain protein  25.78 
 
 		 147 aa  45.4  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  27.4 
 
 		 534 aa  45.1  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1667  hypothetical protein  32.86 
 
 		 129 aa  42  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1802  blue (type1) copper domain-containing protein  27.33 
 
 		 179 aa  41.6  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4485  hypothetical protein  41.51 
 
 		 178 aa  41.6  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.475375  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2975  copper tolerance protein  46.34 
 
 		 143 aa  40.8  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.226437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>