68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_27840 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_27840  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  424  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2350  hypothetical protein  91.76 
 
 
182 aa  346  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3854  uncharacterized copper-binding protein  76.1 
 
 
177 aa  248  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2231  blue (type1) copper domain-containing protein  62.03 
 
 
177 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503031  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1676  blue (type1) copper domain-containing protein  60.53 
 
 
167 aa  184  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549233  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3583  hypothetical protein  52.91 
 
 
175 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1700  blue (type1) copper domain-containing protein  54.19 
 
 
175 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435665 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2159  plastocyanin/azurin family copper binding protein  51.32 
 
 
175 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0076427  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2232  hypothetical protein  46.77 
 
 
185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.53865  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0125  copper-binding protein  45.6 
 
 
177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1635  oxidoreductase  39.07 
 
 
181 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.400621  normal  0.0387336 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2197  blue (type 1) copper domain protein  39.33 
 
 
164 aa  106  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2721  blue (type1) copper domain-containing protein  38.67 
 
 
166 aa  106  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0479159  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2668  blue (type1) copper domain-containing protein  38.07 
 
 
163 aa  105  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  0.234604 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5685  blue (type 1) copper domain protein  41.33 
 
 
168 aa  105  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0348  blue (type1) copper domain-containing protein  37.18 
 
 
189 aa  102  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.471869 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  37.97 
 
 
272 aa  100  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2655  blue (type1) copper domain-containing protein  37.58 
 
 
164 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366193  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6116  putative oxido-reductase protein CopI  35.19 
 
 
158 aa  99.4  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251154  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4824  blue (type1) copper domain-containing protein  34.41 
 
 
160 aa  99.8  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.904248  normal  0.294152 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7873  blue (type 1) copper domain protein  34.13 
 
 
156 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4551  blue (type1) copper domain-containing protein  35.63 
 
 
171 aa  96.3  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3425  putative copper tolerance protein  35.03 
 
 
151 aa  95.9  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.792125  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3487  blue (type1) copper domain-containing protein  36 
 
 
170 aa  95.9  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0575  blue (type1) copper domain-containing protein  34.81 
 
 
154 aa  95.1  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0159129  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1833  blue (type 1) copper domain protein  33.15 
 
 
159 aa  94.7  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584393 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1267  blue (type1) copper domain-containing protein  35.26 
 
 
171 aa  94.4  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034808 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4603  blue (type1) copper domain-containing protein  34.59 
 
 
160 aa  94.4  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5106  blue (type 1) copper domain protein  32.28 
 
 
160 aa  94  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00549955 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6520  putative copper tolerance protein (cupredoxin)  35.06 
 
 
153 aa  94  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2909  blue (type1) copper domain-containing protein  37.58 
 
 
163 aa  92.4  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.272302  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0713  hypothetical protein  32.68 
 
 
190 aa  92  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4269  blue (type1) copper domain-containing protein  32.7 
 
 
161 aa  92  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9844  copper tolerance protein  31.84 
 
 
159 aa  92  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3980  blue (type 1) copper domain protein  33.96 
 
 
166 aa  92  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5030  blue (type1) copper domain-containing protein  31.49 
 
 
159 aa  92  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4583  normal  0.77741 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4902  blue (type1) copper domain-containing protein  31.71 
 
 
156 aa  92  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06367  hypothetical protein  36.84 
 
 
188 aa  91.3  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9849  copper tolerance protein  30.77 
 
 
159 aa  90.1  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0734  blue (type 1) copper domain protein  37.09 
 
 
159 aa  90.1  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3995  blue (type1) copper domain-containing protein  33.77 
 
 
180 aa  88.6  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.704782  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4027  blue (type 1) copper domain protein  31.91 
 
 
162 aa  88.2  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0457304  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3913  blue (type 1) copper domain protein  31.91 
 
 
162 aa  88.2  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444429  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0969  hypothetical protein  33.78 
 
 
169 aa  86.3  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1092  blue (type 1) copper domain protein  31.58 
 
 
165 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5863  blue (type 1) copper domain protein  32.7 
 
 
159 aa  85.5  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1667  blue (type1) copper domain-containing protein  33.99 
 
 
164 aa  85.1  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001394  hypothetical protein  34.67 
 
 
188 aa  84.7  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000508588  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4053  transposase Tn3 family protein  31.45 
 
 
166 aa  84  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3263  putative copper binding protein  35.11 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1207  blue (type 1) copper domain protein  32.03 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2601  blue (type1) copper domain-containing protein  31.37 
 
 
160 aa  78.2  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377321  normal  0.709674 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  24.71 
 
 
505 aa  47.4  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1802  blue (type1) copper domain-containing protein  26.29 
 
 
179 aa  47  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  29.56 
 
 
161 aa  46.2  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  25.69 
 
 
534 aa  46.2  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2634  blue (type 1) copper domain protein  25.17 
 
 
140 aa  43.5  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4485  hypothetical protein  52.5 
 
 
178 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.475375  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3015  hypothetical protein  39.29 
 
 
123 aa  43.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0676858  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1667  hypothetical protein  28.74 
 
 
129 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2975  copper tolerance protein  48.78 
 
 
143 aa  42.4  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.226437  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1660  blue (type 1) copper domain protein  22.6 
 
 
314 aa  42.4  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1421  hypothetical protein  32.88 
 
 
131 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.753032  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1632  hypothetical protein  34.25 
 
 
129 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0700074 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1705  hypothetical protein  34.25 
 
 
129 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0036195  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1561  hypothetical protein  34.25 
 
 
129 aa  41.6  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1420  hypothetical protein  34.25 
 
 
131 aa  41.6  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1448  hypothetical protein  34.25 
 
 
131 aa  41.6  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>