59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_4053 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_4053  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 166 aa  338  2e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3980  blue (type 1) copper domain protein  83.73 
 
 		 166 aa  294  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1267  blue (type1) copper domain-containing protein  55.15 
 
 		 171 aa  189  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034808 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2655  blue (type1) copper domain-containing protein  62.5 
 
 		 164 aa  189  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2909  blue (type1) copper domain-containing protein  57.75 
 
 		 163 aa  181  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.272302  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0734  blue (type 1) copper domain protein  55.56 
 
 		 159 aa  175  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1635  oxidoreductase  58.4 
 
 		 181 aa  166  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.400621  normal  0.0387336 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1207  blue (type 1) copper domain protein  49.09 
 
 		 160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2601  blue (type1) copper domain-containing protein  49.09 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377321  normal  0.709674 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1667  blue (type1) copper domain-containing protein  47.47 
 
 		 164 aa  150  8.999999999999999e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2197  blue (type 1) copper domain protein  51.35 
 
 		 164 aa  132  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2668  blue (type1) copper domain-containing protein  40.36 
 
 		 163 aa  132  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  0.234604 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2721  blue (type1) copper domain-containing protein  49.55 
 
 		 166 aa  130  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0479159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4551  blue (type1) copper domain-containing protein  49.18 
 
 		 171 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4027  blue (type 1) copper domain protein  42.59 
 
 		 162 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0457304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3913  blue (type 1) copper domain protein  42.59 
 
 		 162 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1833  blue (type 1) copper domain protein  44.68 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584393 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5106  blue (type 1) copper domain protein  43.37 
 
 		 160 aa  124  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549955 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6116  putative oxido-reductase protein CopI  45.38 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  46.03 
 
 		 272 aa  121  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3487  blue (type1) copper domain-containing protein  48.65 
 
 		 170 aa  120  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5685  blue (type 1) copper domain protein  47.71 
 
 		 168 aa  120  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4824  blue (type1) copper domain-containing protein  39.63 
 
 		 160 aa  118  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.904248  normal  0.294152 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4603  blue (type1) copper domain-containing protein  45.53 
 
 		 160 aa  117  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7873  blue (type 1) copper domain protein  40.94 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4902  blue (type1) copper domain-containing protein  40.94 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0575  blue (type1) copper domain-containing protein  41.35 
 
 		 154 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0159129  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1092  blue (type 1) copper domain protein  40.16 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4269  blue (type1) copper domain-containing protein  39.16 
 
 		 161 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6520  putative copper tolerance protein (cupredoxin)  39.5 
 
 		 153 aa  99.4  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5030  blue (type1) copper domain-containing protein  37.5 
 
 		 159 aa  98.2  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4583  normal  0.77741 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5863  blue (type 1) copper domain protein  36.72 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9849  copper tolerance protein  33.54 
 
 		 159 aa  95.5  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3425  putative copper tolerance protein  39.5 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.792125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9844  copper tolerance protein  33.54 
 
 		 159 aa  92.8  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2231  blue (type1) copper domain-containing protein  34.67 
 
 		 177 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3854  uncharacterized copper-binding protein  31.82 
 
 		 177 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2350  hypothetical protein  31.06 
 
 		 182 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27840  hypothetical protein  31.45 
 
 		 205 aa  84  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3995  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.704782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0125  copper-binding protein  30.5 
 
 		 177 aa  80.5  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3263  putative copper binding protein  37.37 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0969  hypothetical protein  25.75 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2232  hypothetical protein  31.43 
 
 		 185 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.53865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1700  blue (type1) copper domain-containing protein  28.87 
 
 		 175 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1676  blue (type1) copper domain-containing protein  33.08 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06367  hypothetical protein  32.14 
 
 		 188 aa  70.5  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3583  hypothetical protein  31.65 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2159  plastocyanin/azurin family copper binding protein  31.65 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0076427  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0713  hypothetical protein  30.63 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001394  hypothetical protein  29.73 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000508588  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0348  blue (type1) copper domain-containing protein  33.86 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471869 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2634  blue (type 1) copper domain protein  33.64 
 
 		 140 aa  52  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  29.37 
 
 		 534 aa  45.1  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  28.43 
 
 		 287 aa  44.7  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3489  multicopper oxidase, type 3  34.95 
 
 		 857 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2921  blue (type 1) copper domain protein  32.65 
 
 		 125 aa  43.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0439603  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1326  nitrite reductase, copper-containing  43.24 
 
 		 466 aa  42.4  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.852268  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  28.18 
 
 		 505 aa  40.8  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>