68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0734 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0734  blue (type 1) copper domain protein  100 
 
 		 159 aa  328  1e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1635  oxidoreductase  62.14 
 
 		 181 aa  189  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.400621  normal  0.0387336 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1267  blue (type1) copper domain-containing protein  59.74 
 
 		 171 aa  189  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034808 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2655  blue (type1) copper domain-containing protein  59.03 
 
 		 164 aa  183  9e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3980  blue (type 1) copper domain protein  60 
 
 		 166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4053  transposase Tn3 family protein  55.56 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1667  blue (type1) copper domain-containing protein  52.6 
 
 		 164 aa  174  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1207  blue (type 1) copper domain protein  51.92 
 
 		 160 aa  167  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2601  blue (type1) copper domain-containing protein  51.28 
 
 		 160 aa  166  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377321  normal  0.709674 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2909  blue (type1) copper domain-containing protein  54.55 
 
 		 163 aa  165  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.272302  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  53.28 
 
 		 272 aa  137  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3487  blue (type1) copper domain-containing protein  52.1 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5685  blue (type 1) copper domain protein  49.18 
 
 		 168 aa  128  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4027  blue (type 1) copper domain protein  43.95 
 
 		 162 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0457304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3913  blue (type 1) copper domain protein  43.95 
 
 		 162 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6116  putative oxido-reductase protein CopI  48.74 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1833  blue (type 1) copper domain protein  42.21 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584393 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4551  blue (type1) copper domain-containing protein  49.18 
 
 		 171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5106  blue (type 1) copper domain protein  52.07 
 
 		 160 aa  124  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549955 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2721  blue (type1) copper domain-containing protein  43.7 
 
 		 166 aa  122  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0479159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2197  blue (type 1) copper domain protein  43.7 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2668  blue (type1) copper domain-containing protein  44.54 
 
 		 163 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  0.234604 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4902  blue (type1) copper domain-containing protein  40.94 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1092  blue (type 1) copper domain protein  37.82 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4824  blue (type1) copper domain-containing protein  43.09 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.904248  normal  0.294152 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4603  blue (type1) copper domain-containing protein  43.09 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7873  blue (type 1) copper domain protein  42.52 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3425  putative copper tolerance protein  42.02 
 
 		 151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.792125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6520  putative copper tolerance protein (cupredoxin)  43.7 
 
 		 153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4269  blue (type1) copper domain-containing protein  45.08 
 
 		 161 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5863  blue (type 1) copper domain protein  40.46 
 
 		 159 aa  103  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0575  blue (type1) copper domain-containing protein  39.39 
 
 		 154 aa  102  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0159129  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5030  blue (type1) copper domain-containing protein  36.65 
 
 		 159 aa  101  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4583  normal  0.77741 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9849  copper tolerance protein  34.34 
 
 		 159 aa  101  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9844  copper tolerance protein  38.89 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2231  blue (type1) copper domain-containing protein  36.67 
 
 		 177 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3995  blue (type1) copper domain-containing protein  39.69 
 
 		 180 aa  97.1  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.704782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2350  hypothetical protein  36.84 
 
 		 182 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3263  putative copper binding protein  43.24 
 
 		 176 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3854  uncharacterized copper-binding protein  36.49 
 
 		 177 aa  90.5  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27840  hypothetical protein  37.09 
 
 		 205 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0125  copper-binding protein  38.3 
 
 		 177 aa  88.2  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2232  hypothetical protein  34.23 
 
 		 185 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.53865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1676  blue (type1) copper domain-containing protein  35.46 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0969  hypothetical protein  28.4 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1700  blue (type1) copper domain-containing protein  34.23 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3583  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2159  plastocyanin/azurin family copper binding protein  32.67 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0076427  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0348  blue (type1) copper domain-containing protein  34.06 
 
 		 189 aa  70.9  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471869 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0713  hypothetical protein  28.12 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06367  hypothetical protein  31.15 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001394  hypothetical protein  28.93 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000508588  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  33.06 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1802  blue (type1) copper domain-containing protein  29.24 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1576  hypothetical protein  31 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0471287  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2921  blue (type 1) copper domain protein  29.63 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0439603  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2581  blue-copper-protein-like protein  27.42 
 
 		 147 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1209  blue (type 1) copper domain protein  30.97 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  30.09 
 
 		 287 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2540  blue-copper-protein-like protein  26.02 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00275414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1660  blue (type 1) copper domain protein  20.86 
 
 		 314 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  24.49 
 
 		 534 aa  43.9  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  28.83 
 
 		 505 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  26.98 
 
 		 669 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2634  blue (type 1) copper domain protein  27.83 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4485  hypothetical protein  30.28 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.475375  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1880  blue (type 1) copper domain protein  24.14 
 
 		 722 aa  42  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.459048 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3489  multicopper oxidase, type 3  29.66 
 
 		 857 aa  40.4  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.0660618 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>