40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4485 on replicon NC_008537
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008537  Arth_4485  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  344  3e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.475375  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3637  hypothetical protein  46.07 
 
 		 208 aa  131  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0508  hypothetical protein  55.08 
 
 		 259 aa  125  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.178803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5414  hypothetical protein  55.08 
 
 		 259 aa  125  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0822449 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5394  hypothetical protein  55.08 
 
 		 259 aa  125  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.957207 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2975  copper tolerance protein  35.81 
 
 		 143 aa  63.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.226437  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4335  hypothetical protein  37.84 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324626  normal  0.0167527 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4852  hypothetical protein  33.94 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.69474  normal  0.0614733 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5010  hypothetical protein  35.19 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal  0.0999643 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4905  blue (type1) copper domain-containing protein  30.5 
 
 		 160 aa  51.6  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0465792  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2909  blue (type1) copper domain-containing protein  32.2 
 
 		 163 aa  51.2  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.272302  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9844  copper tolerance protein  33.91 
 
 		 159 aa  51.2  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9849  copper tolerance protein  33.91 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2655  blue (type1) copper domain-containing protein  34.43 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1207  blue (type 1) copper domain protein  26.9 
 
 		 160 aa  48.5  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2634  blue (type 1) copper domain protein  27.7 
 
 		 140 aa  47.8  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6116  putative oxido-reductase protein CopI  32.52 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2601  blue (type1) copper domain-containing protein  30.51 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377321  normal  0.709674 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3995  blue (type1) copper domain-containing protein  34 
 
 		 180 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.704782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3263  putative copper binding protein  32.32 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4824  blue (type1) copper domain-containing protein  30.77 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.904248  normal  0.294152 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  31.53 
 
 		 287 aa  45.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0713  hypothetical protein  22.39 
 
 		 190 aa  45.4  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7873  blue (type 1) copper domain protein  25.15 
 
 		 156 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4603  blue (type1) copper domain-containing protein  30.77 
 
 		 160 aa  45.1  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5030  blue (type1) copper domain-containing protein  30.43 
 
 		 159 aa  45.1  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4583  normal  0.77741 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1635  oxidoreductase  31.58 
 
 		 181 aa  44.7  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.400621  normal  0.0387336 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1267  blue (type1) copper domain-containing protein  29.84 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034808 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5863  blue (type 1) copper domain protein  28.4 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27840  hypothetical protein  52.5 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5106  blue (type 1) copper domain protein  29.13 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549955 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0125  copper-binding protein  32.69 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0734  blue (type 1) copper domain protein  30.28 
 
 		 159 aa  42.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1833  blue (type 1) copper domain protein  30 
 
 		 159 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584393 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4075  hypothetical protein  30.63 
 
 		 145 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000044282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4902  blue (type1) copper domain-containing protein  25.22 
 
 		 156 aa  42  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2668  blue (type1) copper domain-containing protein  29.73 
 
 		 163 aa  42.4  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  0.234604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2350  hypothetical protein  50 
 
 		 182 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06367  hypothetical protein  24.11 
 
 		 188 aa  41.6  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5685  blue (type 1) copper domain protein  30.16 
 
 		 168 aa  41.2  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>