12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4075 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4075  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  280  5.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000044282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3421  hypothetical protein  53.42 
 
 		 176 aa  134  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5638  hypothetical protein  53.76 
 
 		 132 aa  94.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.273492  normal  0.361806 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3846  blue (type 1) copper domain protein  45.05 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.884405  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3041  blue (type 1) copper domain protein  40 
 
 		 157 aa  57  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2353  hypothetical protein  32.26 
 
 		 396 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4774  hypothetical protein  36.75 
 
 		 387 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2921  blue (type 1) copper domain protein  34.15 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0439603  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4485  hypothetical protein  29.08 
 
 		 178 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.475375  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2975  copper tolerance protein  44.19 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.226437  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3899  hypothetical protein  39.47 
 
 		 410 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0203467 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1147  hypothetical protein  30.59 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>