25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2975 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2975  copper tolerance protein  100 
 
 		 143 aa  288  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.226437  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4852  hypothetical protein  29.79 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.69474  normal  0.0614733 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4335  hypothetical protein  29.08 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324626  normal  0.0167527 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5010  hypothetical protein  35.64 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal  0.0999643 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4485  hypothetical protein  35.81 
 
 		 178 aa  63.9  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.475375  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0508  hypothetical protein  36.59 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.178803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5414  hypothetical protein  36.59 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0822449 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5394  hypothetical protein  36.59 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.957207 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3637  hypothetical protein  34.19 
 
 		 208 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4905  blue (type1) copper domain-containing protein  34.21 
 
 		 160 aa  47.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0465792  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1576  hypothetical protein  56.1 
 
 		 167 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0471287  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3041  blue (type 1) copper domain protein  42.86 
 
 		 157 aa  47  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1897  blue (type 1) copper domain protein  35.94 
 
 		 243 aa  44.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3677  hypothetical protein  29.46 
 
 		 157 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1833  blue (type 1) copper domain protein  45.83 
 
 		 241 aa  43.9  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.749286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3995  blue (type1) copper domain-containing protein  31.73 
 
 		 180 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.704782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2601  blue (type1) copper domain-containing protein  62.96 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377321  normal  0.709674 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27840  hypothetical protein  48.78 
 
 		 205 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1207  blue (type 1) copper domain protein  62.96 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4075  hypothetical protein  44.19 
 
 		 145 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000044282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2634  blue (type 1) copper domain protein  31.43 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2350  hypothetical protein  46.34 
 
 		 182 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2909  blue (type1) copper domain-containing protein  44.19 
 
 		 163 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.272302  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3376  blue (type 1) copper domain protein  47.06 
 
 		 186 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176163  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3846  blue (type 1) copper domain protein  42.11 
 
 		 163 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.884405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>