13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4852 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4852  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  286  9e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.69474  normal  0.0614733 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4335  hypothetical protein  96.38 
 
 		 138 aa  276  5e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324626  normal  0.0167527 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5010  hypothetical protein  50.77 
 
 		 138 aa  139  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal  0.0999643 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2975  copper tolerance protein  29.79 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.226437  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4485  hypothetical protein  35.29 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.475375  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0508  hypothetical protein  30.4 
 
 		 259 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.178803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5414  hypothetical protein  30.4 
 
 		 259 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0822449 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5394  hypothetical protein  30.4 
 
 		 259 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.957207 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4905  blue (type1) copper domain-containing protein  31.52 
 
 		 160 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0465792  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2634  blue (type 1) copper domain protein  28.15 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3846  blue (type 1) copper domain protein  26.36 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.884405  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25530  predicted periplasmic lipoprotein involved in iron transport  27.73 
 
 		 406 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0819691  normal  0.228645 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3858  hypothetical protein  28.04 
 
 		 396 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>