17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4335 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4335  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  286  9e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324626  normal  0.0167527 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4852  hypothetical protein  96.38 
 
 		 138 aa  276  5e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.69474  normal  0.0614733 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5010  hypothetical protein  51.13 
 
 		 138 aa  144  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal  0.0999643 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2975  copper tolerance protein  29.08 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.226437  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4485  hypothetical protein  37.84 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.475375  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0508  hypothetical protein  31.36 
 
 		 259 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.178803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5414  hypothetical protein  31.36 
 
 		 259 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0822449 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5394  hypothetical protein  31.36 
 
 		 259 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.957207 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4905  blue (type1) copper domain-containing protein  32.61 
 
 		 160 aa  47  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0465792  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25530  predicted periplasmic lipoprotein involved in iron transport  27.73 
 
 		 406 aa  44.3  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0819691  normal  0.228645 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0230  hypothetical protein  28.44 
 
 		 409 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3858  hypothetical protein  29.17 
 
 		 396 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  31.18 
 
 		 287 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3846  blue (type 1) copper domain protein  25.45 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.884405  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1915  hypothetical protein  44.68 
 
 		 375 aa  40.8  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.395386 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3112  blue (type1) copper domain-containing protein  27.43 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2366  blue (type1) copper domain-containing protein  26.8 
 
 		 159 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0881653  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>