84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4905 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4905  blue (type1) copper domain-containing protein  100 
 
 
160 aa  310  4.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0465792  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  61.06 
 
 
287 aa  147  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3112  blue (type1) copper domain-containing protein  47.15 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  36.05 
 
 
161 aa  83.2  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2366  blue (type1) copper domain-containing protein  46.34 
 
 
159 aa  82  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0881653  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1802  blue (type1) copper domain-containing protein  33.15 
 
 
179 aa  80.9  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2412  blue (type1) copper domain-containing protein  32.39 
 
 
173 aa  73.6  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1100  blue (type 1) copper domain protein  30.34 
 
 
673 aa  66.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303689  normal  0.203492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1897  blue (type 1) copper domain protein  29.87 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65000  azurin precursor  35.71 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5648  azurin precursor  35.71 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.68 
 
 
1180 aa  62.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  32.33 
 
 
669 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0591  blue (type1) copper domain-containing protein  34.92 
 
 
148 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1833  blue (type 1) copper domain protein  41.07 
 
 
241 aa  60.5  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.749286  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6116  putative oxido-reductase protein CopI  32 
 
 
158 aa  59.7  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251154  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  35.04 
 
 
1306 aa  59.7  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0210  blue (type1) copper domain-containing protein  30.95 
 
 
149 aa  57.8  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0250042  normal  0.405619 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1172  blue (type 1) copper domain protein  27.36 
 
 
358 aa  57.8  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1880  blue (type 1) copper domain protein  27.42 
 
 
722 aa  57  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.459048 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001298  azurin  33.33 
 
 
150 aa  55.5  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4485  hypothetical protein  30.16 
 
 
178 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.475375  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4226  azurin  36.63 
 
 
152 aa  54.7  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.151542 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3289  azurin  32.39 
 
 
149 aa  54.7  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.949678  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02282  azurin  37 
 
 
149 aa  54.3  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2909  azurin  33.04 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3263  putative copper binding protein  31.9 
 
 
176 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4923  azurin  31.45 
 
 
136 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3995  blue (type1) copper domain-containing protein  32.03 
 
 
180 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.704782  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3041  blue (type 1) copper domain protein  30.77 
 
 
157 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05169  azurin  28.8 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1209  blue (type 1) copper domain protein  30.36 
 
 
147 aa  50.8  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3376  blue (type 1) copper domain protein  32.09 
 
 
186 aa  50.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176163  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1207  blue (type 1) copper domain protein  27.04 
 
 
160 aa  50.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2435  azurin  34.55 
 
 
155 aa  50.4  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.557296  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4088  azurin  34.12 
 
 
149 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0681809  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4748  azurin  32.81 
 
 
150 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4335  hypothetical protein  33.33 
 
 
138 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324626  normal  0.0167527 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2601  blue (type1) copper domain-containing protein  28.93 
 
 
160 aa  48.9  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377321  normal  0.709674 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1745  electron transfer protein azurin I  32.38 
 
 
151 aa  48.9  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4870  azurin  32.81 
 
 
149 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00722252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.29 
 
 
1171 aa  48.9  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2975  copper tolerance protein  31.13 
 
 
143 aa  48.9  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.226437  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3740  azurin  30.39 
 
 
162 aa  48.5  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2634  blue (type 1) copper domain protein  31.63 
 
 
140 aa  47.8  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5010  hypothetical protein  30.53 
 
 
138 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal  0.0999643 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0335  blue (type 1) copper domain protein  29.76 
 
 
373 aa  47.4  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4824  blue (type1) copper domain-containing protein  30.84 
 
 
160 aa  47  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.904248  normal  0.294152 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1672  azurin  32.38 
 
 
151 aa  47  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  30.17 
 
 
272 aa  47  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4603  blue (type1) copper domain-containing protein  30.84 
 
 
160 aa  47  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0734  blue (type 1) copper domain protein  26.71 
 
 
159 aa  46.6  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5685  blue (type 1) copper domain protein  33.05 
 
 
168 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3581  azurin  28.43 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.46 
 
 
1274 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0658  azurin  28.43 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.998691  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3772  azurin  28.43 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3649  azurin  28.43 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127621  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4852  hypothetical protein  32.26 
 
 
138 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.69474  normal  0.0614733 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5106  blue (type 1) copper domain protein  25.9 
 
 
160 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00549955 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7873  blue (type 1) copper domain protein  30.56 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0966  blue (type1) copper domain-containing protein  54.84 
 
 
251 aa  45.1  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000986426  normal  0.363962 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0658  azurin  37.21 
 
 
149 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000453216 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5394  hypothetical protein  29.41 
 
 
259 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.957207 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0508  hypothetical protein  29.41 
 
 
259 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.178803  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5414  hypothetical protein  29.41 
 
 
259 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0822449 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4662  azurin  29.92 
 
 
150 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0388565 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1535  azurin  26.4 
 
 
153 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0938  blue (type1) copper domain-containing protein  31.13 
 
 
157 aa  44.7  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000352291  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.89 
 
 
1265 aa  44.3  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9844  copper tolerance protein  29.06 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0327  blue (type 1) copper domain protein  34.91 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0741181 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1833  blue (type 1) copper domain protein  27.35 
 
 
159 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584393 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1267  blue (type1) copper domain-containing protein  26.55 
 
 
171 aa  42.4  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034808 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2909  blue (type1) copper domain-containing protein  26.49 
 
 
163 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.272302  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9849  copper tolerance protein  30.84 
 
 
159 aa  41.6  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3421  hypothetical protein  46.34 
 
 
176 aa  41.6  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1667  blue (type1) copper domain-containing protein  27.95 
 
 
164 aa  41.6  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4902  blue (type1) copper domain-containing protein  29.63 
 
 
156 aa  41.2  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1483  hypothetical protein  41.51 
 
 
286 aa  41.2  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.200109 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2231  blue (type1) copper domain-containing protein  28.91 
 
 
177 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503031  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.17 
 
 
1390 aa  40.8  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3180  azurin  26.44 
 
 
158 aa  40.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4926  azurin  31.48 
 
 
150 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000893264 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>