103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2073 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  100 
 
 		 161 aa  332  1e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1802  blue (type1) copper domain-containing protein  50 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2412  blue (type1) copper domain-containing protein  44.57 
 
 		 173 aa  137  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2909  azurin  49.6 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3112  blue (type1) copper domain-containing protein  38.4 
 
 		 159 aa  87  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1535  azurin  41.13 
 
 		 153 aa  85.5  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2366  blue (type1) copper domain-containing protein  36 
 
 		 159 aa  84.3  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0881653  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4870  azurin  35.71 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722252 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0591  blue (type1) copper domain-containing protein  36.22 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4748  azurin  35.71 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4226  azurin  37.6 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.151542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5648  azurin precursor  37.8 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0210  blue (type1) copper domain-containing protein  35.43 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0250042  normal  0.405619 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65000  azurin precursor  37.01 
 
 		 148 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0658  azurin  39.85 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000453216 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3740  azurin  30.88 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1745  electron transfer protein azurin I  33.75 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1209  blue (type 1) copper domain protein  34.19 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  37.9 
 
 		 287 aa  77.8  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2435  azurin  35.71 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.557296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1672  azurin  33.75 
 
 		 151 aa  77  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  33.57 
 
 		 669 aa  76.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4923  azurin  34.68 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02282  azurin  35.07 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4662  azurin  34.29 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0388565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1100  blue (type 1) copper domain protein  31.54 
 
 		 673 aa  74.3  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303689  normal  0.203492 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4926  azurin  33.57 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000893264 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0938  blue (type1) copper domain-containing protein  33.58 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000352291  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4905  blue (type1) copper domain-containing protein  34.81 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0465792  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0546  azurin precursor  34.85 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.148254  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0658  azurin  34.09 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.998691  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3649  azurin  34.09 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3772  azurin  34.09 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3581  azurin  34.09 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1880  blue (type 1) copper domain protein  30.43 
 
 		 722 aa  72.8  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.459048 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3180  azurin  32.35 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  31.2 
 
 		 1265 aa  68.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  34.45 
 
 		 1306 aa  67.8  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4088  azurin  35.66 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0681809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.23 
 
 		 1171 aa  67  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001298  azurin  30.63 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3478  blue (type1) copper domain-containing protein  36.22 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.5 
 
 		 1180 aa  66.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3308  blue (type1) copper domain-containing protein  36.22 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0645  blue (type1) copper domain-containing protein  36.22 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.478569 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1267  blue (type1) copper domain-containing protein  33.73 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034808 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01601  azurin precursor  32.35 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21134  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0327  blue (type 1) copper domain protein  34.11 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0741181 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2721  blue (type1) copper domain-containing protein  34.03 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0479159  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0809  azurin precursor  37.01 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3289  azurin  30.15 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.949678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  31.4 
 
 		 1274 aa  61.2  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2197  blue (type 1) copper domain protein  32.64 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05169  azurin  31.01 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2668  blue (type1) copper domain-containing protein  32.26 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  0.234604 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1635  oxidoreductase  33.06 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.400621  normal  0.0387336 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.35 
 
 		 1390 aa  58.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0348  blue (type1) copper domain-containing protein  31.25 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471869 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3487  blue (type1) copper domain-containing protein  28.22 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1833  blue (type 1) copper domain protein  33.33 
 
 		 241 aa  57.4  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.749286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0556  blue (type1) copper domain-containing protein  32.8 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.73332 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0335  blue (type 1) copper domain protein  28.35 
 
 		 373 aa  57  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0734  blue (type 1) copper domain protein  33.06 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4551  blue (type1) copper domain-containing protein  32.26 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1172  blue (type 1) copper domain protein  30.08 
 
 		 358 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0575  blue (type1) copper domain-containing protein  29.52 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0159129  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7873  blue (type 1) copper domain protein  27.49 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  31.45 
 
 		 272 aa  54.7  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2601  blue (type1) copper domain-containing protein  28.23 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377321  normal  0.709674 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1207  blue (type 1) copper domain protein  28.23 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2909  blue (type1) copper domain-containing protein  28.8 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.272302  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1676  blue (type1) copper domain-containing protein  29.21 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2921  blue (type 1) copper domain protein  32.26 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0439603  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4902  blue (type1) copper domain-containing protein  31.25 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5685  blue (type 1) copper domain protein  32.26 
 
 		 168 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1700  blue (type1) copper domain-containing protein  29.21 
 
 		 175 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435665 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2232  hypothetical protein  23.32 
 
 		 185 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.53865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4824  blue (type1) copper domain-containing protein  27.43 
 
 		 160 aa  51.2  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.904248  normal  0.294152 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3583  hypothetical protein  27.53 
 
 		 175 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2655  blue (type1) copper domain-containing protein  31.2 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4603  blue (type1) copper domain-containing protein  31.3 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2634  blue (type 1) copper domain protein  25.48 
 
 		 140 aa  50.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3854  uncharacterized copper-binding protein  29.58 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6116  putative oxido-reductase protein CopI  27.27 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3425  putative copper tolerance protein  25.87 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.792125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2350  hypothetical protein  30.53 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5106  blue (type 1) copper domain protein  29.6 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549955 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27840  hypothetical protein  28.65 
 
 		 205 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1092  blue (type 1) copper domain protein  30.77 
 
 		 165 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2159  plastocyanin/azurin family copper binding protein  26.97 
 
 		 175 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0076427  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1667  blue (type1) copper domain-containing protein  27.13 
 
 		 164 aa  47.8  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4269  blue (type1) copper domain-containing protein  27.14 
 
 		 161 aa  47.4  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2231  blue (type1) copper domain-containing protein  27.85 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1833  blue (type 1) copper domain protein  22.02 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584393 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3263  putative copper binding protein  28.23 
 
 		 176 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2109  hypothetical protein  24.84 
 
 		 153 aa  45.1  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6520  putative copper tolerance protein (cupredoxin)  28 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3913  blue (type 1) copper domain protein  24.28 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4027  blue (type 1) copper domain protein  24.28 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0457304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3995  blue (type1) copper domain-containing protein  28.23 
 
 		 180 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.704782  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>