43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2109 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2109  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  318  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1576  hypothetical protein  35.29 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0471287  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2540  blue-copper-protein-like protein  37.25 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00275414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2581  blue-copper-protein-like protein  36.63 
 
 		 147 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0385  hypothetical protein  28.12 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3677  hypothetical protein  27.69 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2981  hypothetical protein  35.58 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.227676  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1660  blue (type 1) copper domain protein  25.66 
 
 		 314 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5863  blue (type 1) copper domain protein  26.28 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2634  blue (type 1) copper domain protein  32.08 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9844  copper tolerance protein  24.2 
 
 		 159 aa  50.4  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9849  copper tolerance protein  23.42 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  29.57 
 
 		 272 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0348  blue (type1) copper domain-containing protein  20.93 
 
 		 189 aa  47  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471869 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3357  RND family efflux transporter MFP subunit  36.07 
 
 		 409 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.748521  hitchhiker  0.00540648 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  28.07 
 
 		 505 aa  47  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0540  RND family efflux transporter MFP subunit  37.7 
 
 		 459 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1012  hypothetical protein  27.62 
 
 		 129 aa  44.3  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3848  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 423 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3995  blue (type1) copper domain-containing protein  25.62 
 
 		 180 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.704782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5685  blue (type 1) copper domain protein  27.93 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  22.31 
 
 		 534 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2909  blue (type1) copper domain-containing protein  31.86 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.272302  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3263  putative copper binding protein  26.13 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6520  putative copper tolerance protein (cupredoxin)  23.89 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2655  blue (type1) copper domain-containing protein  26.62 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3342  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 421 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0477  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 440 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2721  blue (type1) copper domain-containing protein  22.94 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0479159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3974  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 440 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2197  blue (type 1) copper domain protein  22.02 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3015  hypothetical protein  27.92 
 
 		 123 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0676858  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4551  blue (type1) copper domain-containing protein  26.61 
 
 		 171 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0575  blue (type1) copper domain-containing protein  25 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0159129  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3792  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.67 
 
 		 440 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  29.46 
 
 		 669 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2668  blue (type1) copper domain-containing protein  24.77 
 
 		 163 aa  40.8  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  0.234604 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1635  oxidoreductase  30.17 
 
 		 181 aa  40.8  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.400621  normal  0.0387336 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5030  blue (type1) copper domain-containing protein  21.02 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4583  normal  0.77741 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1092  blue (type 1) copper domain protein  30 
 
 		 165 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4082  RND family efflux transporter MFP subunit  36.07 
 
 		 455 aa  40.8  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2601  blue (type1) copper domain-containing protein  29.91 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377321  normal  0.709674 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  25.68 
 
 		 161 aa  40.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>