42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3677 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3677  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  321  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1576  hypothetical protein  59.31 
 
 		 167 aa  177  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0471287  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2581  blue-copper-protein-like protein  57.34 
 
 		 147 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2540  blue-copper-protein-like protein  60.55 
 
 		 153 aa  148  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00275414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0385  hypothetical protein  36.51 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2981  hypothetical protein  31.61 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.227676  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1949  hypothetical protein  34.71 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.129845  normal  0.699527 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2109  hypothetical protein  27.69 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6116  putative oxido-reductase protein CopI  26.67 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2921  blue (type 1) copper domain protein  26.72 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0439603  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7873  blue (type 1) copper domain protein  28.93 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2634  blue (type 1) copper domain protein  29.29 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  26.52 
 
 		 534 aa  49.7  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4603  blue (type1) copper domain-containing protein  23.08 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4824  blue (type1) copper domain-containing protein  22.22 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.904248  normal  0.294152 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5011  hypothetical protein  26.23 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.334367  normal  0.114174 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1660  blue (type 1) copper domain protein  26.47 
 
 		 314 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4902  blue (type1) copper domain-containing protein  25.64 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3263  putative copper binding protein  30.7 
 
 		 176 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5315  hypothetical protein  24.39 
 
 		 144 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1799  hypothetical protein  31.15 
 
 		 144 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155326 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2975  copper tolerance protein  29.46 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.226437  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1207  blue (type 1) copper domain protein  25.22 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2601  blue (type1) copper domain-containing protein  25.23 
 
 		 160 aa  43.9  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377321  normal  0.709674 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1676  blue (type1) copper domain-containing protein  24.82 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9844  copper tolerance protein  23.23 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3995  blue (type1) copper domain-containing protein  29.82 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.704782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2183  hypothetical protein  32.11 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.713238  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1833  blue (type 1) copper domain protein  25.96 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584393 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2668  blue (type1) copper domain-containing protein  26.83 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  0.234604 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5106  blue (type 1) copper domain protein  25.71 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549955 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1848  hypothetical protein  32.11 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.831934 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4267  CopA family copper resistance protein  28.57 
 
 		 630 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3425  putative copper tolerance protein  25.76 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.792125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1667  blue (type1) copper domain-containing protein  25.47 
 
 		 164 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2197  blue (type 1) copper domain protein  25.45 
 
 		 164 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4269  blue (type1) copper domain-containing protein  23.26 
 
 		 161 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1092  blue (type 1) copper domain protein  24.81 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0348  blue (type1) copper domain-containing protein  27.13 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471869 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  27.59 
 
 		 505 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  25 
 
 		 579 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2721  blue (type1) copper domain-containing protein  25 
 
 		 166 aa  40.8  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0479159  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>