25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2581 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2581  blue-copper-protein-like protein  100 
 
 
147 aa  301  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1576  hypothetical protein  59.86 
 
 
167 aa  180  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0471287  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3677  hypothetical protein  57.34 
 
 
157 aa  171  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2540  blue-copper-protein-like protein  52.21 
 
 
153 aa  160  8.000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00275414  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2981  hypothetical protein  35.37 
 
 
150 aa  94.7  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.227676  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0385  hypothetical protein  39.02 
 
 
146 aa  89.4  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2109  hypothetical protein  36.63 
 
 
153 aa  67  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1660  blue (type 1) copper domain protein  31.67 
 
 
314 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1949  hypothetical protein  30.33 
 
 
145 aa  57  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.129845  normal  0.699527 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6116  putative oxido-reductase protein CopI  27.87 
 
 
158 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251154  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0734  blue (type 1) copper domain protein  27.42 
 
 
159 aa  47.4  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7873  blue (type 1) copper domain protein  23.44 
 
 
156 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1676  blue (type1) copper domain-containing protein  26.85 
 
 
167 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549233  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4902  blue (type1) copper domain-containing protein  24.19 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4603  blue (type1) copper domain-containing protein  22.61 
 
 
160 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4824  blue (type1) copper domain-containing protein  21.74 
 
 
160 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.904248  normal  0.294152 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0348  blue (type1) copper domain-containing protein  30.43 
 
 
189 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.471869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4269  blue (type1) copper domain-containing protein  25.41 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9844  copper tolerance protein  25.98 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3995  blue (type1) copper domain-containing protein  24.79 
 
 
180 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.704782  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1092  blue (type 1) copper domain protein  23.89 
 
 
165 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1635  oxidoreductase  22.73 
 
 
181 aa  40.8  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.400621  normal  0.0387336 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9849  copper tolerance protein  25.2 
 
 
159 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5863  blue (type 1) copper domain protein  25 
 
 
159 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3421  hypothetical protein  30.19 
 
 
176 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>