22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1949 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1949  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  288  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.129845  normal  0.699527 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5315  hypothetical protein  42.28 
 
 		 144 aa  104  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1799  hypothetical protein  43.33 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155326 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2610  hypothetical protein  39.86 
 
 		 142 aa  100  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5011  hypothetical protein  40 
 
 		 147 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.334367  normal  0.114174 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2183  hypothetical protein  43.22 
 
 		 144 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.713238  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1848  hypothetical protein  43.22 
 
 		 144 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.831934 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2719  hypothetical protein  39.83 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198095  normal  0.18171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3677  hypothetical protein  33.81 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1576  hypothetical protein  33.57 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0471287  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2584  hypothetical protein  31.82 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1939  hypothetical protein  30.91 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1242  hypothetical protein  31.82 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.114711  normal  0.983634 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2540  blue-copper-protein-like protein  33.64 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00275414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2666  hypothetical protein  31.68 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0587658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0385  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2581  blue-copper-protein-like protein  30 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0485  hypothetical protein  33.75 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.788041  normal  0.823231 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0028  hypothetical protein  32.53 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3936  hypothetical protein  31.43 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2981  hypothetical protein  32.8 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.227676  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3005  hypothetical protein  24.6 
 
 		 145 aa  41.2  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00286306  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>