15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3936 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3936  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  298  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0485  hypothetical protein  66.9 
 
 		 145 aa  201  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.788041  normal  0.823231 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0028  hypothetical protein  54.1 
 
 		 189 aa  146  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1939  hypothetical protein  52.46 
 
 		 147 aa  144  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2584  hypothetical protein  51.64 
 
 		 147 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1242  hypothetical protein  51.64 
 
 		 147 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.114711  normal  0.983634 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2666  hypothetical protein  49.59 
 
 		 148 aa  137  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0587658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2610  hypothetical protein  37 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2719  hypothetical protein  45.21 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198095  normal  0.18171 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5011  hypothetical protein  40.54 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.334367  normal  0.114174 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2183  hypothetical protein  40.54 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.713238  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1848  hypothetical protein  40.54 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.831934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1799  hypothetical protein  40.54 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155326 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5315  hypothetical protein  39.19 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1949  hypothetical protein  31.43 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.129845  normal  0.699527 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>